组间比较 Mann-Whitney 检验答案

【问题标题】：comparison Mann-Whitney test between groups组间比较 Mann-Whitney 检验
【发布时间】：2018-07-24 09:14:07
【问题描述】：

在我的数据集中我有列：

group 是分组 var
var 这是范围变量

我只需要比较组 1-2 和 1-3。如何使用wilcox.test？
这里是数据。

mydat=structure(list(group = c(1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 3L, 
3L, 3L, 3L), var = c(23L, 24L, 24L, 23L, 23L, 24L, 24L, 23L, 
23L, 24L, 24L, 23L)), .Names = c("group", "var"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-12L))

【问题讨论】：

标签： r dplyr data.table

【解决方案1】：

您可以通过group split 您的data.frame 然后lapply 测试您想要的组对。

lst <- split(mydat, mydat$group)
lapply(lst[-1], function(DF) wilcox.test(DF$var, lst[[1]]$var, exact = FALSE))

【讨论】：

我很抱歉，但也许你可以在这个相关的帖子中帮助我？ stackoverflow.com/questions/51495838/…

【解决方案2】：

您也可以尝试视觉解决方案。

library(tidyverse)
library(ggsignif)
ggplot(mydat, aes(factor(group), var)) + 
    geom_boxplot() + 
    geom_signif(comparisons = list(c(1,3), c(1,2)), test = "wilcox.test", 
                test.args = list(exact = FALSE),step_increase = 0.1)

【讨论】：