需要使用仅限 NA 的数据创建 ggplot 热图，但得到“错误：必须从色调调色板中请求至少一种颜色。”答案

【问题标题】：Need to create ggplot heatmap with NA-only data, but get "Error: Must request at least one colour from a hue palette."需要使用仅限 NA 的数据创建 ggplot 热图，但得到“错误：必须从色调调色板中请求至少一种颜色。”
【发布时间】：2020-01-02 19:50:03
【问题描述】：

我需要创建单行热图，偶尔会从仅 NA 列派生，但无论如何都必须显示。在下面的示例中，从 p2 列生成热图将呈现“错误：必须从色调调色板中请求至少一种颜色。”。有什么方法可以强制 ggplot 显示“空”热图？

library(ggplot2)
id <- letters[1:5]
p1 <- factor(c(1,NA,2,NA,3))
p2 <- factor(c(NA,NA,NA,NA,NA))
dat <- data.frame(id=id, p1=p1, p2=p2)

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + geom_tile(aes(fill = p1), colour = "white") #works fine

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + geom_tile(aes(fill = p2), colour = "white") #renders error

【问题讨论】：

如果将scale_fill_manual(values = "white") 添加到不起作用的那个怎么办？不确定在这种情况下您希望它是什么样子。
@MrFlick 这确实解决了问题：ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + geom_tile(aes(fill = p2)) + scale_fill_manual(values = "red ") 感谢您的帮助！
如果问题的回答令您满意，请考虑通过勾选它旁边的复选标记来接受答案 - 这样它就不会再标记为“未回答”。谢谢

标签： r ggplot2 heatmap

【解决方案1】：

我想如果你明确告诉ggplot 如何在scale_fill_manual 调用中使用na.value 处理NA 值。这应该可以解决您的问题，或者至少引导您朝着正确的方向前进：

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + 
  geom_tile(aes(fill = p2), colour = "white") + 
  scale_fill_manual(values = "white", 
                    na.value = "black")

您可以更改values 参数以更好地处理您喜欢的颜色

【讨论】：

是的，你是对的，戴夫。 scale_fill_maual 成功了。谢谢帮忙！