【发布时间】:2019-11-04 07:51:59
【问题描述】:
我有一些看起来像这样的数据:
<int> hgnc_symbol
<fctr> structure
<int> Promedio_senal
<dbl>
>8903 MECP2 10225 7.006842
>3216 CDKL5 10225 7.484454
>1405 AUTS2 10225 12.801426
>4254 DAPK1 10225 6.171004
>12160 RBFOX1 10225 30.756440
>8903 MECP2 10185 6.595135
>3216 CDKL5 10185 6.067631
>1405 AUTS2 10185 11.053545
>4254 DAPK1 10185 6.222515
>12160 RBFOX1 10185 25.431652
原来它不是一个数据表,所以我通过这样做把我变成了一个:
G_OBJ[, structure:=factor(structure, levels = 1:2, labels = c("10225", "10185"))]
setDT(G_OBJ)
我想做一个条形图,其中 x 轴是基因的名称 (hgnc_symbol),y 轴是基因表达 (Promedio_senal) 我有关于两种不同大脑结构的数据,我想用不同的颜色并排显示两种结构的条形图。我用来执行此操作的代码如下:
G_OBJ[, structure:=factor(structure, levels = 1:2, labels = c("10225", "10185"))]
ggplot(G_OBJ, aes(hgnc_symbol, Promedio_senal)) +
geom_col(aes(fill=structure), position = "dodge")+
scale_x_discrete("GEN") +
scale_y_continuous("EXPRESION") +
labs(title = "GENES_OBJETIVO")
但是当我运行它时会出现以下错误消息:
错误:必须从色调调色板中请求至少一种颜色。
我认为错误在于我尝试使用结构作为填充颜色的部分,但我不确定;即使是我不知道要改变什么才能使它正确 感谢您的帮助
【问题讨论】:
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您能否以
dput的形式分享您的数据样本以获得更好的重现性?使用dput(head(df,n))。