如何增加 heatmap.2() 中颜色范围的最大值答案

【问题标题】：How to increase the max values of color range in heatmap.2()如何增加 heatmap.2() 中颜色范围的最大值
【发布时间】：2019-07-24 09:42:57
【问题描述】：

我有以下代码：

my_palette <- colorRampPalette(rev(RColorBrewer::brewer.pal(11, "RdBu")))(n = 50)
par(mar = c(7, 4, 4, 2) + 0.1)
gplots::heatmap.2(as.matrix(mtcars),
  Colv = TRUE,
  Rowv = TRUE,
  col = my_palette,
  density.info = "none",
  key = TRUE,
  scale = "none",
  ylab = "Y_LABEL",
  xlab = "X_LABEL",
  trace = "none",
  margins = c(12, 8))

它产生了这个情节：

请注意，颜色键中最红的颜色对应于 mtcars 的最大值，即 472。

有没有办法将最大值增加到 1000，以便热图中的颜色范围从 0 到 1000？

使用该方案，值为 472 的单元格将少得多红色，甚至是蓝色或白色。

【问题讨论】：

标签： r plot heatmap

【解决方案1】：

一种方法是手动指定您用于颜色的breaks（见最后一行）：

# NOTE: starting from R v3.6.0 base has palettes, so you don't need RColorBrewer
my_palette <- hcl.colors(64, palette="RdBu", rev=TRUE)

par(mar = c(7, 4, 4, 2) + 0.1)
gplots::heatmap.2(as.matrix(mtcars),
                  Colv = TRUE,
                  Rowv = TRUE,
                  col = my_palette,
                  density.info = "none",
                  key = TRUE,
                  scale = "none",
                  ylab = "Y_LABEL",
                  xlab = "X_LABEL",
                  trace = "none",
                  margins = c(12, 8),
                  breaks=seq(0,1000,1000/length(my_palette)))

【讨论】：