为 pheatmap 图中的特定单元格着色

【问题标题】：Coloring a specific cell in pheatmap graph为 pheatmap 图中的特定单元格着色
【发布时间】：2019-09-13 09:24:47
【问题描述】：

我正在尝试为使用R 包pheatmap 创建的图表中的任意单元格着色。

简短示例：

library (pheatmap)

dat <- as.data.frame (scale (mtcars))

pheatmap (dat,
          color = colorRampPalette (c ("white", "red")) (5),
          cluster_rows = FALSE,
          cluster_cols = FALSE,
)

结果：

我想要用任意颜色为特定单元格着色，所以我得到这样的结果：

有什么想法可以实现吗？

【问题讨论】：

标签： r colors pheatmap

【解决方案1】：

您可以将需要不同颜色的单元格设置为NA。然后，使用pheatmap 的na_col 选项，您可以为这些单元格设置颜色。

library (pheatmap)
dat <- as.data.frame(scale(mtcars))

# Set to NA the cells 
dat[, 10] <- NA
dat[10, 6] <- NA
dat[16, 4:6] <- NA

pheatmap(dat,
          color = colorRampPalette (c ("white", "red")) (5),
          cluster_rows = FALSE,
          cluster_cols = FALSE,
          na_col = "blue"
)

【讨论】：