【问题标题】：how to tell f2py module to look in current directory for shared object dependency如何告诉 f2py 模块在当前目录中查找共享对象依赖项
【发布时间】：2019-01-15 15:29:41
【问题描述】：

system: lubuntu 18.04, running in VirtualBox

假设我有以下源目录（底部的代码）：

/f2pyproject/
  - lib.f
  - prog.f
  - f2pyprog.f
  - test.py

prog.f 是一个简单的 fortran 可执行文件，它将调用从lib.f 编译的共享对象中的子例程。

要实现这一点：

>>> gfortran -shared lib.f -o lib.so
>>> gfortran prog.f lib.so -o prog.exe -Wl,-rpath=.
>>> ./prog.exe
    hello world

-Wl,-rpath=. 选项告诉 prog.exe 在当前目录中查找其链接的共享对象，这样我就不用担心$LD_LIBRARY_PATH

现在我想在 python 中调用这个相同的链接子例程，所以我用 f2py 调用编译 f2pyprog.f：

>>> python3 -m numpy.f2py -c f2pyprog.f lib.so -m prog

现在在这种情况下，prog.cpython-blah-blah.so 是一个共享对象，而不是一个可执行文件，所以我不知道的是，如何调用此工作流而不必担心 LD_LIBRARY_PATH 但将共享对象保存在与f2py 编译库。

调用 test.py 失败：

>>> python3 test.py  (fails with ImportError, cannot open shared object file)

先设置 LD_LIBRARY_PATH 成功：

>>> export LD_LIBRARY_PATH=`pwd`
>>> python3 test.py
    hello world

主要问题：

是否可以使用类似 -rpath 链接器选项的方式在当前目录中链接共享对象来构建这个（或任何）f2py 扩展，而不必担心$LD_LIBRARY_PATH 环境变量？

来源：

lib.f:

  subroutine helloworld()
      print*, "hello world"
  return
  end subroutine

prog.f:

  program helloworldprog
    call helloworld()
  end program helloworldprog

f2pyprog.f:

  subroutine pyhelloworld()
    call helloworld()
  return
  end subroutine

test.py

import os
from os import path
# has no effect, presumably because this needs to be set before python starts
os.environ['LD_LIBRARY_PATH'] = path.abspath(path.dirname(__file__))  

import prog
prog.pyhelloworld()

【问题讨论】：

标签： python linux shared-libraries f2py

【解决方案1】：

设置环境变量export LDFLAGS=-Wl,-rpath=.
设置环境变量export NPY_DISTUTILS_APPEND_FLAGS=1
将numpy 升级到1.16.0 或更高版本

虽然您不能在 f2py 中从命令行传递链接器标志，但它会读取 LDFLAGS 环境变量。但是，默认的behavior for numpy is to overwrite the flags 用于编译而不是附加它们，如果LDFLAGS 中不存在所需的标志，则会导致编译失败。 Support was added in numpy version 1.16.0 用于通过设置环境变量 NPY_DISTUTILS_APPEND_FLAGS=1 选择性地附加这些链接器标志

>>> unset LD_LIBRARY_FLAGS   # just in case was set before
>>> export LDFLAGS=-Wl,-rpath=.
>>> export NPY_DISTUTILS_APPEND_FLAGS=1
>>> python3 -m numpy.f2py -c progpy.f lib.so -m prog
>>> python3 test.py
    hello world

【讨论】：