字符向量作为 R 脚本的参数答案

【问题标题】：Character vector as an argument to R script字符向量作为 R 脚本的参数
【发布时间】：2012-12-12 12:50:38
【问题描述】：

我正在运行 R 脚本，但遇到错误：

Rscript 例子.R "a,b,c"

我在上面运行代码，其中 a、b、c 是作为参数传递的字符向量的元素。如果我传递数值（例如 1,5,6），上面的代码可以正常工作

Code is :
library("optparse")
library("tldutils") # eval_string
# install.packages("tldutils", repos="http://R-Forge.R-project.org")
option_list <- list(
make_option(c("-c", "--count"), type="character", default="5",
help='Vector of numbers separated by commas and surrounded by ""',
metavar="number")
)
args <- parse_args(OptionParser(option_list = option_list))
print(args$c)
eval_string(sprintf("foo = c(%s)", args$c))
print(foo)

错误是：

Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'a' not found
Calls: eval_string -> eval.parent -> eval -> eval
Execution halted

请帮帮我，我需要在哪里编辑代码？

【问题讨论】：

标签： r

【解决方案1】：

不确定我是否得到了你所追求的，但我希望你能够自己弄清楚细节并解决你的问题。

将字符向量作为参数传递给 R 的最简单方法是使用 commandArgs 函数（基本包的，无需安装任何花哨的东西）。

# Start R from the shell
$ R --args a,b,c

# Within R
> commandArgs()
[1] "/usr/lib64/R/bin/exec/R" "--args"                 
[3] "a,b,c"

如果您只想获取--args 之后指定的参数，请使用trailingOnly=TRUE。添加strsplit 将"a,b,c" 转换为三元素向量。或者，将逗号更改为空格，您不需要strsplit。

$ R --args a,b,c
...
> strsplit(commandArgs(TRUE), ",")[[1]]
[1] "a" "b" "c"

$ R --args a b c
...
> commandArgs(T)
[1] "a" "b" "c"

【讨论】：

【解决方案2】：

您传递给脚本的“a,b,c”被解释为变量名，而不是字符串。

编辑：无论如何，我不明白您为什么要将数据作为参数而不是 a) 从标准输入中读取或更好 b）使用例如read.table从文件中读取它

【讨论】：