如何使用 Process builder 从 Java 运行 R 脚本答案

【问题标题】：How to run R script from java using Process builder如何使用 Process builder 从 Java 运行 R 脚本
【发布时间】：2016-11-07 20:31:23
【问题描述】：

这应该很简单，但我不断收到错误消息。我有一个摇摆应用程序。当用户按下按钮时，系统会提示他们选择要打开的 R 文件。 Rscript 路径存储在用户首选项中。然后 Processbuilder 应该运行脚本：

Processbuilder的方法如下

 public static void open(File document) throws IOException, ScriptException {
        Preferences userPrefs = Preferences.userNodeForPackage(TBB_SQLBuilder.class);
        String pt=document.getAbsolutePath().toString().trim()   
        Process process = new ProcessBuilder(userPrefs.get("PathToR",null)+" '"+pt+"'").start();
  }

但是它给了我错误：

java.io.IOException: Cannot run program "/Applications/RStudio.app '/Users/sebastianzeki/Myscript.R'": error=2, No such file or directory

当我将 R 路径（在 MacOSX ElCapitaine 上）更改为 /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/Rscript 时，我得到了同样的错误

尝试运行Runtime.getRuntime().exec(userPrefs.get("PathToR",null)); 也会给我一个错误，但这次是：

Cannot run program "/Applications/RStudio.app": error=13, Permission denied

但是当我使用 Rscript 时我没有得到这个 RStudio 和 Rscript 的权限设置为所有人读写。

我想做的就是在 R 中运行我的脚本（这会输出一个我的应用程序提取的 csv）

我知道 Renjin（不支持 dplyr）JRI 和 rJava（带有路径等的杂乱安装）和 RServe（只是不喜欢它），因此将我的脚本作为外部脚本运行的 Process builder 对我来说是最佳选择。

我做错了什么？

【问题讨论】：

标签： java r

【解决方案1】：

ProcessBuilder 的构造函数接受的不是命令行，而是命令及其参数。所以，在这个例子中，它应该被构造为

new ProcessBuilder(userPrefs.get("PathToR",null), pt);

此构建器将使用单个参数 pt 运行 R。请注意，即使pt 包含空格，它也会被解释为单个参数。

【讨论】：