在R中循环遍历nc文件

【问题标题】：Looping through nc files in R在R中循环遍历nc文件
【发布时间】：2020-05-03 13:28:09
【问题描述】：

大家早上好，我目前正在使用 Antonio Olinto Avila-da-Silva 在此链接上编写的代码：https://oceancolor.gsfc.nasa.gov/forum/oceancolor/topic_show.pl?tid=5954 它允许我从 nc 文件中提取 sst/chlor_a 类型的数据。它使用一个循环来创建一个包含所有数据的 excel 文件。不幸的是，我注意到该函数只获取循环中的第一个数据文件。因此，我发现自己在我的 excel 文件中连续有 20 倍相同的数据。有没有人有办法让这个循环正常工作？

【问题讨论】：

欢迎来到 SO！如果问题是可重现的，人们会更容易提供帮助。这是一个指南here，其中包含提示和技巧。由于 SO 将永远存在，因此使问题尽可能独立是很重要的。上面的 URL 可能会立即消失并使这个问题成为孤立的……话虽如此，我浏览了脚本并确定了我认为的问题所在，但不能肯定地说，因为这是不可重现的。下面回答。祝你好运！

标签： r loops ncdf4

【解决方案1】：

我会首先检查这两行是否包含您期望的所有文件：

(f <- list.files(".", pattern="*.L3m_MO_SST_sst_9km.nc",full.names=F))
(lf<-length(f))

然后在 for 循环中有一个错误。这一行：

data<-nc_open(f)

需要引用迭代器i，所以改成这样：

data<-nc_open(f[[i]])

看来这两个脚本都有同样的错误。

【讨论】：