如何在 /etc/profile 中设置 R 环境？答案

【问题标题】：How to set R environment in /etc/profile?如何在 /etc/profile 中设置 R 环境？
【发布时间】：2012-07-29 01:30:38
【问题描述】：

我的操作系统是debian6，我编译安装R后有一个libR.pc

root@debian:/home/tiger# cat /home/tiger/R-2.15.1/lib/pkgconfig/libR.pc  
rhome=/home/tiger/R-2.15.1/lib/R  
rlibdir=${rhome}/lib  
rincludedir=/home/tiger/R-2.15.1/lib/R/include  
Name: libR  
Description: R as a library  
Version: 2.15.1  
Libs: -L${rlibdir} -lR  
Cflags: -I${rincludedir} -I${rincludedir}  
Libs.private:

在 /etc/profile 中设置 R 环境时：
R_HOME= /home/tiger/R-2.15.1
或
R_HOME= /home/tiger/R-2.15.1/lib/R
我会选择在 /etc/profile 中写入哪一行？

【问题讨论】：

相关问题：stackoverflow.com/questions/11004531/…

标签： r environment

【解决方案1】：

在 Debian（或衍生产品，例如 Ubuntu 系统）上，您有 /etc/R/ 来设置 R 使用的变量：

edd@max:~$ ls -l /etc/R/
total 28
-rw-r--r-- 1 root root  602 Jun 17 20:29 ldpaths
-rw-r--r-- 1 root root 5461 Jun 17 20:29 Makeconf
-rw-r--r-- 1 root root 1868 Mar 31 13:50 Renviron
-rw-r--r-- 1 root root  608 Sep 25  2009 Renviron.site
-rw-r--r-- 1 root root 1159 Mar 31 08:03 repositories
-rw-r--r-- 1 root root  792 Oct 28  2009 Rprofile.site
edd@max:~$

R_HOME/etc/ 中的文件应该是软链接 --- 至少如果您使用预构建的二进制文件。如果您构建自己的二进制文件，那是您的问题。

您引用的文件在 Debian / Ubuntu 系统上安装为 /usr/lib/pkgconfig/libR.pc。 不需要设置R_HOME，因为R 会找到自己的值（请参阅@flodel 的答案）。

【讨论】：

【解决方案2】：

在我的系统上：

cat $R_HOME

什么都不提供，但在 R 会话中，我得到：

> Sys.getenv("R_HOME")
[1] "/usr/lib/R"

这应该告诉你两件事：

R_HOME 是在 R 的启动时设置的，所以除非您确切知道自己在做什么，否则您可能不需要在您的 /etc/profile 中设置它。
您可以使用Sys.getenv 找出您的R_HOME 的确切路径。

【讨论】：