【发布时间】:2018-07-10 21:51:04
【问题描述】:
我正在尝试开发一个包,我需要在其中输入来自用户的函数(可以使用Rcpp 或R 定义),将其发送到struct 中的另一个函数(在包内)并在那里处理它。
当我使用Rcpp::Xptr(即函数指针)时,代码可以工作,但同样不能用于Rcpp::Function。为用户使用Rcpp::Function 的好处是他们可以在R 中定义函数(尽管会损失很多性能增益)。
首先什么是有效的:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// define the structure
struct xptr_data{
SEXP xptr;
};
// a minimal function (user-defined)
// [[Rcpp::export]]
NumericVector timesTwo(NumericVector x) {
return x * 2;
}
// pointer to function defined
typedef NumericVector (*funcPtr) (NumericVector y);
// [[Rcpp::export]]
XPtr<funcPtr> putFunPtrInXPtr() {
XPtr<funcPtr> rhs_ptr(new funcPtr(×Two), false);
return rhs_ptr;
}
// this function will be in the package
NumericVector call_by_xptr_struct(NumericVector y, void* user_data){
struct xptr_data *my_rhs_ptr = (struct xptr_data*)user_data;
SEXP xpsexp = (*my_rhs_ptr).xptr;
// use function pointer to get the derivatives
XPtr<funcPtr> rhs_xptr(xpsexp);
funcPtr rhs_fun = *rhs_xptr;
// use the function to calculate value of RHS ----
return(rhs_fun(y));
}
// using xptr to evaluate function - this will be exported
// from the package
//[[Rcpp::export]]
NumericVector xptr_call_struct(NumericVector y, SEXP xpsexp){
struct xptr_data my_xptr = {NULL};
my_xptr.xptr = xpsexp;
return call_by_xptr_struct(y, (void*)&my_xptr);
}
/*** R
rhs_ptr <- putFunPtrInXPtr()
xptr_call_struct(c(1,2), rhs_ptr)
[1] 2 4
*/
什么是行不通的,
如果函数在R中定义,而我直接使用Rcpp::Function,它会导致整个R会话崩溃,
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// define the function based structure
struct func_data{
Function func;
};
// processes the input function
NumericVector call_by_func_struct(NumericVector y, void* user_data){
struct func_data *my_rhs_fun = (struct func_data*)user_data;
Function func = (*my_rhs_fun).func;
return(func(y));
}
// this will be exported from the package
//[[Rcpp::export]]
NumericVector func_call_struct(NumericVector y, Function func){
struct func_data my_func = {NULL};
my_func.func = func;
return call_by_func_struct(y, (void*)&my_func);
}
/*** R
timesThree <- function(y){
y <- 3 * y
y
}
*/
上面的代码编译得很好,但是当我调用函数 func_call_struct(c(1,2), timesThree)) 时,它会导致整个 R 会话崩溃。
任何关于为什么R 崩溃以及如何输入R 中定义的函数的指导都会非常有帮助。
此外,有没有办法传递Rcpp 中定义的输入函数(例如,上面的timesTwo)而不是它们的Xptr。我认为在不牺牲Rcpp 带来的速度的情况下,最终用户的困惑会稍微少一些(因为他们不必生成函数指针)。
【问题讨论】: