如何可视化 Vegdist 在 Vegan 中产生的距离矩阵？

Question

使用 R 包 Vegan 可以使用 vegdist 函数生成距离矩阵：

distance.matrix <- vegdist(my.data)

我想在演示文稿中实际展示距离矩阵，以帮助解释它的 NMDS 图是基于什么的。我怎样才能做到这一点？

'distance.matrix' 是'Class 'dist' atomic...'。我只想在表格中查看它，显示每个站点之间的距离？

Answer 1

您想查看距离矩阵吗？输入它的名字怎么样？

distance.matrix
as.matrix(distance.matrix) # in full symmetric form

或者如果您想以图形方式查看它，请尝试

heatmap(as.matrix(distance.matrix))

几个包可能有更高级的工具。