通过 R 中的现有函数循环来自两个数据框列的名称答案

【问题标题】：Loop names from two dataframe columns through an existing function in R通过 R 中的现有函数循环来自两个数据框列的名称
【发布时间】：2020-12-08 19:16:24
【问题描述】：

我有一个数据框中的植物名称列表。植物名称以“属”后跟“种”的对联形式出现。在我的情况下，对联已经跨列拆分（这应该会有所帮助）。作为三个物种（向日葵、辐射松和白千层）的虚拟示例：

df <- data.frame(genus=c("Helianthus", "Pinus", "Melaleuca"), species=c("annuus","radiata", "leucadendra"))

我想使用包“Taxize”中的一个函数来对照数据库 (IPNI) 检查这些名称。没有批处理功能，烦人的查询单个名称的格式是：

checked <- ipni_search(genus='Helianthus', species='annuus')

我需要一个循环来将每个属名及其相关的物种名输入到该函数中。我可以这样做：

list <- df$genus
checked <- lapply(list, function(z) ipni_search(genus=z))

但我被各种试图通过它传递物种的结束缚。

任何帮助表示赞赏！干杯

【问题讨论】：

标签： r loops

【解决方案1】：

在索引上循环（或*apply），而不是实际值：

checked = lapply(
  1:nrow(df),
  function(i) ipni_search(genus = df$genus[i], species = df$species[i])
)

或者，您可以使用Map，它用于并行迭代多个向量/列表：

checked = Map(ipni_search, genus = df$genus, species = df$species)

【讨论】：