STAN 模型块中不存在变量“cholesky_factor_cov”答案

【问题标题】：Variable "cholesky_factor_cov" does not exist in STAN model blockSTAN 模型块中不存在变量“cholesky_factor_cov”
【发布时间】：2019-09-03 01:12:29
【问题描述】：

我正在尝试从边缘化高斯混合模型的后验分布进行模拟。这是我的代码：


data {
  int<lower=0> d;
  int<lower=0> n;         
  int<lower=0> k;
  row_vector[d] y[n];
  vector[d] mu0;
  cov_matrix[d] sig0;
  real<lower=0> alpha;
}
parameters {
  vector[d] mu[k];
  cov_matrix[d] sig[k];
  // simplex[k] pi;
}


model {
   cholesky_factor_cov[d] chol_sig[k];
  for(i in 1:k)
    chol_sig[i]=cholesky_decompose(sig[i]);

  vector[k] lps;

  for( i in 1:k){
    target+= multi_normal_cholesky_lpdf(mu[i] | mu0, chol_sig[i]);
    target+= inv_wishart_lpdf(sig[i] | d+10, sig0);
  }


  for (i in 1:n) {
    // lps = log_thet;
    for (j in 1:k)
      lps[j] = multi_normal_cholesky_lpdf(y[i] | mu[j], chol_sig[j]);
    target += log_sum_exp(lps);
  }
}

它抛出以下错误：

SYNTAX ERROR, MESSAGE(S) FROM PARSER:
Variable "cholesky_factor_cov" does not exist.
 error in 'model728c4ff59f3c_mixture' at line 34, column 22
  -------------------------------------------------
    32: // }
    33: model {
    34:    cholesky_factor_cov[d] chol_sig[k];
                             ^
    35:   for(i in 1:k)
  -------------------------------------------------

Error in stanc(file = file, model_code = model_code, model_name = model_name,  :
  failed to parse Stan model 'mixture' due to the above error.

我不能在 STAN 模型中声明“cholesky_factor_cov”类型的变量吗？请帮忙。

【问题讨论】：

标签： r stan rstan

【解决方案1】：

您不能在 Stan 程序的 model 块内声明矩阵或向量的特化，因为它们没有经过有效性检查。但是您可以将其声明为方阵数组，例如

model {
  matrix[d,d] chol_sig[k];
  ...

【讨论】：