从 MatLab 调用 R 脚本 - 错误

Question

我想从MatLab 调用一个R 脚本，比如myRfile.R。我正在使用带有MatLab 2017a 和R-3.4.2 的Windows 10 机器。我按照之前stackoverflow question. 中的建议使用system 命令，解决方案是执行以下操作：

1. 添加R的安装位置路径。就我而言，我写 addpath C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin。

2. 确保 R 脚本位于工作目录（或路径）中。

3. 调用函数system('R CMD BATCH myRfile.R')。

然而，我得到错误标志 = 1 并且在命令窗口中打印以下内容：

'R' 未被识别为内部或外部命令， 可运行的程序或批处理文件。

我通过导航到适当的文件并调用 R.exe 来检查以确保我可以从 cmd 运行 R。相反，如果我通过以下方式致电system：

system('"C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin\x64\R.exe" CMD 批处理 myRfile.R');,

然后脚本被正确执行（没有错误）。因此，我找到了解决我的问题的方法。但是，我想定义字符串

Rpath = "C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin\x64\R.exe"

在我的程序开始并运行命令

system('Rpath CMD BATCH myRfile.R');

这会返回与之前类似的错误：

'Rpath' 未被识别为内部或外部命令， 可运行的程序或批处理文件。

问题：

1. 为什么命令system('R CMD BATCH myRfile.R') 对我不起作用？

2. 如果我将R 的目录直接写为字符串，为什么system 命令会起作用，但如果我通过Rpath 将字符串传递给它，它就不起作用？

Answer 1

在@r2evans cmets 的基础上，解决方案是使用setenv 而不是addpath，因为system 使用系统路径来搜索文件。 Program 和Files 之间的空格对于system 命令也有问题。

示例解决方案：

% Get the current set of system paths
path1 = getenv('PATH'); 
% Append directory for R to the system path    
path1 = [path1'C:\PROGRA~1\R\R-34~1.2\bin\x64']; 
% Update system path
setenv('PATH', path1) 
% Run the system command.
system('R CMD BATCH myRfile.R'); 

一般来说，获得正确路径的一种方法是打开R 的实例并输入命令file.path(R.home())。对我来说，这会返回 "C:/PROGRA~1/R/R-34~1.2". Finally, append\bin\x64`。

@excaza 指出定义R 路径的字符串应该被"" 包围，以便cmd 正确解释空格。解决方案2：

path1 = getenv('PATH'); 
% Append directory for R to the system path    
path1 = [path1'"C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin\x64"']; 
% Update system path
setenv('PATH', path1) 
% Run the system command.
system('R CMD BATCH myRfile.R');