如何在 jython 脚本中保存来自 ROI 管理器的 ROI？

【问题标题】：How to save ROIs from ROI manager in jython script?如何在 jython 脚本中保存来自 ROI 管理器的 ROI？
【发布时间】：2014-03-28 03:46:30
【问题描述】：

我正在编写一个半自动的 juthon 脚本。在某些时候，脚本会停止等待用户手动添加一些 ROI。我需要一种方法来保存添加到 ROI 管理器的所有 ROI。我尝试了以下方法：

RoiManager.runCommand("Save", ROIsOutpath)

但我收到以下错误：

TypeError: runCommand(): self arg can't be coerced to ij.plugin.frame.RoiManager

当然，我正在学习 jython（以及一般的编程）。简短的问题是：如何从 Jython 的 ROImanager 中保存多个 ROI？

谢谢！！

【问题讨论】：

标签： jython imagej roi

【解决方案1】：

RoiManager#runCommand() 方法不是静态的，这意味着您必须在RoiManager 类的实例上调用它。要获取此实例，请调用：

rm = RoiManager.getInstance();
if (rm==None):
    rm = RoiManager();

以下代码打开一个示例图像，创建两个 ROI，并将它们保存在用户的 home 目录中：

from ij.plugin.frame import RoiManager;

rm = RoiManager.getInstance();
if (rm==None):
    rm = RoiManager();
imp = IJ.openImage("http://imagej.nih.gov/ij/images/blobs.gif");
imp.setRoi(100, 80, 50, 80);
rm.addRoi(imp.getRoi());
imp.setRoi(180, 140, 30, 40);
rm.addRoi(imp.getRoi());
rm.runCommand("Deselect"); # deselect ROIs to save them all
rm.runCommand("Save", IJ.getDirectory("home") + "RoiSet.zip");
imp.show();

希望对您有所帮助。

【讨论】：