【问题标题】:How do you use ImageJ to measure the columnarity of the cells?如何使用 ImageJ 测量细胞的柱状度?
【发布时间】:2020-03-30 09:52:39
【问题描述】:

所以,我有一个 .czi 文件,它是一些单元格的图像。它有几个 z 堆栈。我想要做的是测量它们的柱状性,即,我希望能够“转换”该图像,以便我可以从一侧查看它们,而不是从上方查看单元格(因此,看看是否他们的柱状与否)。

我尝试了 reslice 选项,但是,对于它给我的最终图像,我发现很难看到一个单元格何时结束以及下一个单元格何时开始。

我还有其他选择吗?或者我可以对重新切片的图像进行任何其他处理,使其更清晰?

提前致谢。

【问题讨论】:

    标签: imagej


    【解决方案1】:

    选择 Image > Stacks > Orthogonal Views(Mac 快捷键是 cmd + shift + H)这将在 XY 视图的右侧和底部显示 YZ 和 XZ 视图。使用光标将黄色十字准线移动到您要检查的任何单元格。

    【讨论】:

    • 感谢您的回答,但我试过了,正交视图比重新切片的图像更不清晰。
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