【问题标题】:Copy Azure API for FHIR data into datalake将 Azure API for FHIR 数据复制到 datalake
【发布时间】:2020-04-22 12:04:11
【问题描述】:

我已经为 FHIR 服务器配置了 Azure API,我可以将一些数据推送到其中。使用 post man 我可以查询服务器并读取 json 文件。

现在,我想继续下一步。将数据移动到数据湖中,然后在其上应用一些机器学习模型。

首先 - Accessing the FHIR data in Microsoft Azure Storage explorer using the managed version - 根据此评论,使用托管版本时无法在 Cosmos DB 中查看数据。

现在,我对 FHIR 服务器数据的存储位置感到非常困惑。我提交的患者信息很少,我不确定它是否存储在数据库中。

我还有其他几个问题。要从 FHIR 服务器中获取数据,我应该先将其导出到 cosmos Db,然后设置一个数据工厂以将数据复制到 datalake 中,还是有什么办法,我可以直接创建一种管道类型的东西,让数据从中进入 datalake fhir-serve 自己。

有人可以指导吗?

【问题讨论】:

    标签: azure hl7-fhir fhir-server-for-azure


    【解决方案1】:

    这个问题似乎与您的其他问题有相当大的重叠。您可以使用$export 将数据从 FHIR API 导出到其他形式的存储,例如BLOB 存储,然后从那里编排任何有意义的管道。

    当然,在托管 FHIR API 后面有一个数据库,但无法直接访问托管服务中的该数据存储。如果您想查看数据库架构,我建议您查看该服务的开源版本 (https://github.com/Microsoft/fhir-server)。但是,我建议不要对架构进行任何特定的依赖,因为它可能会发生变化。

    【讨论】:

    • 在托管版本中,如果我可以创建一个存储并运行导出命令,数据将被复制到存储中?
    • 或者是不是这样,每当我们需要将数据导出到外部存储时,我们都需要使用开源版本
    • 删除所有资源并重新创建。现在,数据正在导出到存储帐户。谢谢
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