R - 在多个系统发育树（multiPhylo 对象）上运行函数答案

【问题标题】：R - Running functions on multiple pylogenetic trees (multiPhylo objects)R - 在多个系统发育树（multiPhylo 对象）上运行函数
【发布时间】：2018-01-04 14:23:52
【问题描述】：

我想在存储为 multiPhylo 对象的多个系统发育中运行相同的函数。

例如，假设我有 1,000 棵树的 multiPhylo，我想对每棵树的边/分支长度求和。我知道我可以只使用一棵树：

sum(tree$edge.length)

但我不知道如何对 multiPhylo 中的所有树执行此操作。我确信这很简单，但它超出了我的范围。有人可以帮忙吗？

谢谢

丹

【问题讨论】：

标签： r tree phylogeny

【解决方案1】：

multiPhylo 类是一个列表 (str(tree))，因此提供了 R 用来处理列表的功能。要对单个树的边长度求和，请使用 lapply 函数。

lapply(tree, FUN = function(x) sum(x$edge.length))

【讨论】：

非常感谢，帮了大忙。