不允许重复的“row.names”错误

Question

我正在尝试加载一个包含 14 列的 csv 文件，如下所示：

StartDate, var1, var2, var3, ..., var14

当我发出这个命令时：

systems <- read.table("http://getfile.pl?test.csv", header = TRUE, sep = ",")

我收到一条错误消息。

不允许有重复的行名

在我看来，第一列名称是导致问题的原因。当我手动下载文件并从文件中删除StartDate 名称时，R 成功读取文件并将第一列名称替换为X。有人可以告诉我发生了什么吗？该文件是一个（逗号分隔的）csv 文件。

Answer 1

我使用read_csv 来自readr package

根据我的经验，read.csv 函数中的参数row.names=NULL 会导致错误读取 如果缺少列名，则文件，即每列都将被移动。

read_csv 解决了这个问题。

Answer 2

This related question 指出了?read.table 文档的一部分，它解释了您的问题：

如果有一个标题并且第一行包含一个较少的字段 比列数，使用输入中的第一列 对于行名称。否则，如果缺少 row.names，则对行进行编号。

您的标题行可能比文件的其余部分少 1 列，因此read.table 假定第一列是 row.names（必须都是唯一的），而不是列（可以包含重复值） .您可以使用以下两种解决方案之一来解决此问题：

1. 将分隔符（即\t 或,）添加到源文件中标题行的开头或结尾，或者，
2. 删除数据中的任何尾随分隔符

选择取决于您的数据结构。

示例：
这里标题行被解释为比数据少一列，因为分隔符不匹配：

v1,v2,v3   # 3 items!!
a1,a2,a3,  # 4 items
b1,b2,b3,  # 4 items

这是默认的解释方式：

   v1,v2,v3   # 3 items!!
a1,a2,a3,  # 4 items
b1,b2,b3,  # 4 items

第一列（没有标题）值被解释为 row.names：a1 和 b1。如果此列包含重复项，这是完全可能的，那么您会收到 duplicate 'row.names' are not allowed 错误。

如果您设置row.names = FALSE，则不会发生移位，但由于分隔符不匹配，标题和数据中的项目数仍然不匹配。

解决方案 1 将尾随分隔符添加到标题：

v1,v2,v3,  # 4 items!!
a1,a2,a3,  # 4 items
b1,b2,b3,  # 4 items

解决方案 2 从非标题行中删除多余的尾随分隔符：

v1,v2,v3   # 3 items
a1,a2,a3   # 3 items!!
b1,b2,b3   # 3 items!!

Answer 3

看来问题可能由多个原因引起。当我遇到相同的错误时，以下两个步骤有效。

1. 我将文件保存为 MS-DOS csv。 （之前它被保存为 csv , excel starter 2010 ）。 在记事本++中打开csv。没有昏迷不一致（一致性如上所述@Brian）。
2. 注意到我没有使用参数 sep="," 。我用过，它有效（尽管这是默认参数！）

Answer 4

@adrianoesch 的答案 (https://stackoverflow.com/a/22408965/2236315) 应该会有所帮助（例如，解决“如果您知道一个不需要在您的评论中提到的尴尬解决方法的解决方案（移动列名，复制数据），那会很棒。”和“......要求复制数据”由@Frank提出）。

请注意，如果您在某些文本编辑器中打开，您应该会看到标题字段的数量少于标题行下方的列数。就我而言，数据集在最后一个标题字段的末尾缺少一个“，”。

Answer 5

在我的例子中，每行末尾都有一个逗号。通过删除有效

Answer 6

我在打开 CSV 文件时遇到此错误，其中一个字段中嵌入了逗号。该字段周围有引号，我已经剪切并粘贴了 read.table，其中包含 quote="" 。一旦我把 quote="" 拿出来， read.table 的默认行为就会接管并解决问题。所以我从这个出发：

systems <- read.table("http://getfile.pl?test.csv", header=TRUE, sep=",", quote="")

到这里：

systems <- read.table("http://getfile.pl?test.csv", header=TRUE, sep=",")

Answer 7

此错误的另一个可能原因是您复制了整行。如果是这种情况，则通过删除重复行来解决问题。

Answer 8

然后告诉 read.table not 使用row.names:

systems <- read.table("http://getfile.pl?test.csv", 
                      header=TRUE, sep=",", row.names=NULL)

现在您的行将被简单地编号。

还可以查看read.csv，它是read.table 的包装器，它已经设置了sep=',' 和header=TRUE 参数，以便您的调用简化为

systems <- read.csv("http://getfile.pl?test.csv", row.names=NULL)