如何通过 MPI 将结构作为数组发送？答案

【问题标题】：How to send structure as array over MPI?如何通过 MPI 将结构作为数组发送？
【发布时间】：2018-11-09 14:22:38
【问题描述】：

我有这个结构

typedef struct { float x, y, z, vx, vy, vz; } 正文；

float *buf, *bufSlave;
Body *p;
bytes = nBodies*sizeof(Body);
buf = (float*)malloc(bytes);
p = (Body*)buf;

如何使用 MPI_SEND 发送 15 个元素以及如何使用 MPI_RECEIVE 接收？

MPI_Send(&p[(i - 1) * lung], 6, MPI_FLOAT, i, 99, MPI_COMM_WORLD);

我有分段错误。

【问题讨论】：

标签： c mpi openmpi

【解决方案1】：

首先，请注意，该方法适用于具有相同架构的同构集群。

对于一般情况和高稳定性，请选择安全的传输协议，例如 JSON 或协议缓冲区。

第三，将 boost::serialization 转换为 stringstreams 会很方便。类似的限制，但不需要库。

不管怎样，现在答案是：当你想发送结构体时，使用数据类型 MPI_CHAR 和 count N * sizeof(Struct)

对于接收，要么您已经知道 N，要么使用 MPI_Probe 并从消息中提取计数。这将是多个字节。分配一个这个大小的缓冲区，MPI_RECV 到里面，并通过强制转换将它重新解释为一个 Buffer 数组。

基本原理是通过 MPI_CHAR 因为结构可能有填充。

【讨论】：

这是一个讽刺/幽默的回答吗？ MPI 派生的数据类型在这里是最合适的（性能、可移植性和易用性）。只要您的 MPI 库可以支持此类配置，它也适用于异构系统。
评论荒谬。虽然使用 MPI_FLOAT 可能更好，但问题是关于发送一个结构。复制和打包数组是使用 MPI_FLOAT 的唯一方法。由于我们不知道为什么数据在结构中的原因，我们仍然应该支持提出问题的人。
MPI_FLOAT 不是派生数据类型。让我们同意在其他所有问题上不同意。
我从来没有说过 MPI_FLOAT。问题是关于结构的。我的回答是正确的，您只提供正确的建议，但不适合问题的情况。
在您对我的评论的回复中，我读了两次MPI_FLOAT。你可能从来没有说过任何关于它的事情，但你肯定写过两次。我只提到要声明这不是派生数据类型，我从来没有写过应该使用这个。无论如何，让我们再尝试（尝试）同意不同意。