将 mpiexec/mpirun 与静态二进制文件一起发送

Question

我有一个使用 MPI 的并行代码。使用此代码的正确方法是从 PC/Cluster 上的源代码编译，然后运行为：

mpiexec -n X ./application -options

不幸的是，有些使用此代码的人受到 *nix 挑战，他们发现从源代码构建有点令人生畏（不要问为什么）。这些用户只在自己的台式机/笔记本电脑上使用代码。

对于这样的用户，我只需编译一个静态二进制文件（在一个足够老的操作系统上使用足够老的 glibc，它可以在大多数运行 Linux 的 PC 上运行）。然后用户可以按如下方式运行代码：

./application -options

所以现在我的问题是如何将 mpiexec/mpirun 与我的静态二进制文件一起发布，以便用户可以执行以下操作：

./mpiexec -n 2 ./application -options

这样，他们还可以利用桌面上的多个内核。到目前为止，我一直在告诉他们做正确的事情，即安装 MPI 并从源代码编译我的代码。

通过一些测试，我发现如果我编译 hydra 并将 mpiexec.hydra 和 hydra_pmi_proxy 一起发送，那么我可以运行代码如下：

./mpiexec.hydra -n 2 ./application -options

但我不确定这是否是正确的方法？这会导致任何问题吗？我正在考虑对 Windoze 二进制文件（在 Cygwin 中运行）做同样的事情。

另一种选择是预先构建所有内容的 VBox 图像，但下载大文件会成为问题。

Answer 1

由于您使用的是 Hydra，我假设您使用的是 MPICH 或基于它的东西。

仅提供一小部分完整安装的问题是可能会丢失功能。您可以假设不愿意自己设置 MPI 的用户只会使用某些功能，如果需要更多功能，只需告诉他们正确安装即可。

还有一个更令人担忧的情况需要考虑。如果他们已经安装了 MPI，但它不是您要运送的，您需要确定您的 MPI 是第一个找到的。在 Windows 中，只需将二进制文件和库放在同一个文件夹中，Windows 会首先找到它们。 Linux 有点棘手，但你可以操纵 PATH 和 LD_LIBRARY_PATH 来获得你的第一个。另一种选择是将 mpirun 调用包装在脚本中。这样可以更轻松地设置您想要的路径，并且更高级的用户可以简单地忽略它。