visNetwork with R：如何防止节点与边缘重叠

【问题标题】：visNetwork with R: How to prevent nodes from overlapping with edgesvisNetwork with R：如何防止节点与边缘重叠
【发布时间】：2018-03-11 01:44:10
【问题描述】：

我正在使用 visNetwork（用于动态可视化）来可视化具有 47 个节点的二分图。

visNetwork(nodes, edges) %>%
     visIgraphLayout(layout = 'layout.davidson.harel')

上面的图片是它目前的样子，这是我们在尝试了一些布局（Fruchterman Reingold 等）后能想到的最好的。我遇到的问题是边缘往往很长，所以一些节点对相距很远。谁能建议一种防止节点与边缘重叠的布局？

【问题讨论】：

标签： r visnetwork

【解决方案1】：

您的数据集的大小表明依赖 visNetwork 来计算布局坐标是可以接受的，而不是通过visIgraphLayout 的 igraph：

visNetwork(nodes, edges) %>%
    visPhysics(solver = "forceAtlas2Based",
               forceAtlas2Based = list(gravitationalConstant = -100))

Layout via visNetwork

为了比较，用 igraph 绘制相同的数据：

visNetwork(nodes, edges) %>%
   visIgraphLayout(layout = 'layout.davidson.harel')

Layout via igraph

【讨论】：