如何防止graphviz中的边缘相互重叠答案

【问题标题】：How to prevent edges in graphviz to overlap each other如何防止graphviz中的边缘相互重叠
【发布时间】：2011-04-27 10:12:48
【问题描述】：

我有一个我在 graphviz 中创建的图，但问题是边缘相互重叠（我每行有 5-7 个节点），因此很难判断每个节点是它连接的节点.

如何使边缘不相互重叠？让它们相互交叉就可以了。

【问题讨论】：

阅读文档graphviz.gitlab.io/_pages/pdf/neatoguide.pdf 第 4 节。它说无法防止边缘重叠。它说这是“未来工作的领域”。我有一个非常大的图表，因此重叠=比例会产生非常小的打印，重叠=假是愚蠢的密集！我希望有一种方法可以做一点 voronoi 和一点规模，而不是非此即彼。
经过一些试验，我对dot -Granksep=2 -Gnodesep=1 -Grankdir=LR -Gsplines=ortho -Nshape=box 很满意。您可以增加框和sep 的大小，最终获得零重叠。不幸的是，neato 和 twopi 不允许使用 nodeep，所以你被 dot 困住了

【解决方案1】：

我假设你有一个用点布局的有向图。

我认为没有防止重叠边缘的神奇开关。 Graphviz 尝试开箱即用。

一些可能有帮助的建议，具体取决于图表：

【讨论】：

如何设置ports属性？
@divog 只需添加 : 后跟端口到节点 ID（另见 graphviz.gitlab.io/_pages/doc/info/lang.html ），例如 node1:ne -> node2:nw

【解决方案2】：

另一种方法是向图形添加重叠属性。允许的属性是 scale（这将大大增加输出的大小）或 false（这不会增加大小，但可能会导致边缘与节点重叠）。

overlap = scale;

如果您使用overlap=false，您可以通过添加属性splines=true:来消除与节点的边缘重叠

overlap = false;
splines = true;

这将显着减慢大型图的生成时间。

【讨论】：

我在哪里将这些属性添加到图表中？我将它们插入到图表的主体中，结果没有任何变化。
添加 graph [overlap=false, splines=true]; 也无助于我的重叠边缘。
overlap 不受 DOT 引擎支持。
overlap 只处理节点重叠，与边缘重叠无关。
请注意，这些可以在控制台上指定，如下所示：neato -Goverlap=false -Gsplines=true -Tpdf inputFile > outputFile

【解决方案3】：

即使对于非常微不足道的图表，我也看到 graphviz (neato, fdp) 会产生重叠。例如：

graph G {
0;
1;
2;
3;
0--1 ;
1--2 ;
2--3 ;
3--0 ;
}

在我的代码2.38.0 版本中产生一个交叉。

来自documentation，他们建议在这些情况下尝试使用不同的随机种子。最终，对于更复杂的图表，交叉将是不可避免的，我不确定引擎在避免交叉方面付出了多少努力。

例如，这对我有用：

neato -Gstart=5 file.dot -Tps -o file.ps

【讨论】：

链接现在好像坏了（2018-05-31）。这个正在工作：graphviz.gitlab.io/faq/#FaqNeatoEdgeCrossings
如何使用我的输入设置参数？ stackoverflow.com/questions/52562208/…
@alfC 请点击链接，我解释命令行并提供示例。我使用的是neato 和 dot，在这两种情况下，有些边缘都被简单地交叉了。
@skan，我找到了，但是我没有找到命令行，你能在这里重复一遍吗？
我正在使用 R 中的 Diagrammer。我告诉它在内部使用 Graphviz 来生成图表。我首先定义节点和边，定义一些属性，例如neato布局，并将所有内容存储在“图形”上。最后我使用命令 render_graph(graph)