Packrat 在闪亮的服务器上工作吗？答案

【问题标题】：Does packrat work on shiny server?Packrat 在闪亮的服务器上工作吗？
【发布时间】：2014-12-16 03:13:52
【问题描述】：

当我从 Rstudio 运行时，我的闪亮应用程序运行良好，但在闪亮服务器（开源）上运行时，我的闪亮应用程序运行良好，这对我来说似乎很奇怪（开源），不使用 packrat 私有库。我使用 .libPaths() 进行检查，但未显示私有库。我是否需要进行任何配置才能使其正常工作？谢谢。

paste0(.libPaths(),' shinyBS version:',as.character(packageVersion('shinyBS')))

在工作室

[1] "C:/R/ADAP/packrat/lib/i386-w64-mingw32/3.1.1 shinyBS version:0.25"
[2] "C:/R/ADAP/packrat/lib-ext shinyBS version:0.25"                   
[3] "C:/R/ADAP/packrat/lib-R shinyBS version:0.25"

在闪亮的服务器上

shinyBS version:0.20 Lib:/usr/lib64/R/library shinyBS version:0.20 Lib:/usr/share/R/library

【问题讨论】：

标签： r shiny shiny-server

【解决方案1】：

有一个配置文件.Renviron，其中包含一个环境变量R_LIBS。这是您的 R 会话（和.libPaths()）了解在哪里查找库的地方。要更改默认值，请不要直接编辑 .Renviron 文件，而是在同一目录中创建一个副本并将其命名为 .Renviron.site。在这个新文件中编辑 R_LIBS 变量。这可以防止您的配置更改在升级时被安装程序覆盖。

【讨论】：

【解决方案2】：

我能够让 Packrat 使用闪亮的开源服务器。

这是我在 CentOS 中的目录结构：

/srv/shiny-server/sample-apps/test1/
  .Rprofile
  packrat/
  server.R
  ui.R

在此示例中，我将 packrat 生成的 .Rprofile 文件和 packrat/ 目录（包含已编译的库）以及 server.R 和 ui.R 文件复制到 test1 目录。

为应用创建 R 进程后，packrat 库已正确加载。

为了验证，我可以这样做：

cd /srv/shiny-server/sample-apps/
sudo cp -r test1 test2
cd test2
sudo rm .Rprofile
sudo rm -rf packrat/

然后，当我访问 http://localhost:3838/sample-apps/test2/ 时，packrat 库没有加载。

请注意，在某些情况下，必须重新启动 Shiny 服务器才能使更改生效（例如，如果用户当前正在使用该应用程序，则该应用程序的 R 进程将不会自动重新加载新库）。使用sudo systemctl restart shiny-server 重新启动（在 CentOS 上）。

【讨论】：