在闪亮的服务器上部署打包的闪亮应用答案

【问题标题】：Deploy packaged shiny app on shiny server在闪亮的服务器上部署打包的闪亮应用
【发布时间】：2016-12-28 03:24:19
【问题描述】：

当为闪亮的服务器设置这样的闪亮应用时

+---/srv/shiny-server
|   +---shinyApp1
|       +---server.R
|       +---ui.R

一切正常。但是，当上述文件（ui.R、server.R）包含在包inst/shiny 文件夹中时，我该怎么做？（例如，请参阅我的gridsampler repo）。

如何在闪亮的服务器上部署打包的闪亮应用？

【问题讨论】：

标签： r shiny shiny-server

【解决方案1】：

你可以做我该做的。

我在 my shiny server 上的软件包中托管了很多闪亮的应用程序，我所做的只是将 setwd() 放到闪亮应用程序的目录中，然后调用 shinyAppDir(".")。

例如：this code负责this app

2.5 年后编辑：请注意，如果您有 global.R 文件，这将不起作用 - 请参阅 github 上的此问题 https://github.com/rstudio/shiny/issues/1063

我的解决方法是明确来源 global.R

【讨论】：

这是一个不错的解决方案。谢谢。
我同意，我以后可能也会使用这种方法。
试过了，但我收到一个关于应用程序找不到在global.R 中定义的变量的错误 - 似乎无法弄清楚原因。不过，我建议的符号链接方法有效。
进行了一些挖掘，global.R 在此配置中不会有意工作，但有一些解决方法（如明确来源），现在它可以工作了。在这里讨论：groups.google.com/forum/…
是的，这是真的。我确实觉得这很烦人。很久以前，我在 RStudio 的 github 问题中打开了一个关于该问题的错误，请随时在此处添加您的意见，以向他们表明其他人也认为这很烦人 :) 我的解决方法是明确来源 global.R

【解决方案2】：

我采用了简单的方法，只是将包从 GitHub 克隆到了 shiny-server 目录，并且必须手动链接到 inst/shiny 子目录，请参阅 my hosted version of gridsampler 作为示例（注意非漂亮的 URL）。 shiny-server 设置为托管应用程序目录，因此您需要点击进入应用程序的visiting the root URL 时的概览。

其他可能性可能包括将存储库克隆到 shiny-server 文件夹之外的某个位置，并将 inst/shiny 文件夹符号链接到 shiny-server 文件夹中作为 gridsampler，如果设置了适当的权限，afaik 应该可以工作。

【讨论】：

如何链接到inst/shiny 子目录？在服务器配置中或链接意味着什么。你能详细说明一下吗？
@MarkHeckmann Linking as in "copy the URL to that subdirectory", ie https://gauss.tadaa-data.de/projects/gridsampler/inst/shiny/ – 这可能需要将闪亮服务器设置为托管应用程序目录，请参阅docs.rstudio.com/shiny-server/#host-a-directory-of-applications配置信息。我的闪亮服务器是这样设置的，服务器根目录如下所示：paste.xinu.at/2Lojkf
我认为更简单的方法是使用shinyAppDir()从安装目录运行应用程序
@DeanAttali，是否可以在运行在 ubuntu 上的 R Shiny 服务器中安装“github.com/JinmiaoChenLab/cytofkit2/blob/master/R/…”？如果是这样，你能告诉我怎么做吗？