如何解决`sf`安装错误：在标准或给定位置找不到proj_api.h

Question

我需要在 CentOS 7 中为 R 安装 sf 包。

gdal 和 proj 的 repo 版本低于软件包所需的版本，因此我从源安装它们。

即使链接这些库，我总是会遇到同样的错误：

configure: GDAL: 3.2.0
checking proj.h usability... no
checking proj.h presence... no
checking for proj.h... no
checking proj_api.h usability... no
checking proj_api.h presence... no
checking for proj_api.h... no
configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
ERROR: configuration failed for package ‘sf’

我尝试了不同的命令，并从不同的来源（CRAN、GitHub、本地）得到相同的错误。

例如：

install_github("r-spatial/sf", configure.args="--with-gdal-config=/usr/local/gdal-3.2.0/bin/gdal-config --with-proj-lib=/usr/local/proj-7.2.0/lib --with-proj-include=/usr/local/proj-7.2.0/include")

proj_api.h 存在于指定路径：

locate proj_api.h
/usr/local/proj-7.2.0/include/proj_api.h

Answer 1

解决方案非常简单。我只是将/usr/local/proj-7.2.0/include 中的文件复制到/usr/local/include，并将/usr/local/proj-7.2.0/lib 中的文件复制到/usr/local/lib。

然后我在/etc/ld.so.conf.d 中添加了一个.conf 文件，其中包含/usr/local/proj-7.2.0/lib 的路径并运行sudo ldconfig。

似乎其他包在自定义位置识别proj，sf 没有。特别是，这部分什么都不做"--with-proj-lib=/usr/local/proj-7.2.0/lib", "--with-proj-include=/usr/local/proj-7.2.0/include"。

安装sf 的命令行是install.packages("sf", configure.args="--with-gdal-config=/usr/local/gdal-3.2.0/bin/gdal-config --with-geos-config=/usr/local/bin/geos-config")，没有引用proj。

无需更改操作系统或降级库。

Answer 2

我今天遇到了同样的问题，但我无法使用其他解决方案，因为我没有 root 访问权限。问题是因为配置文件使用pkgconfig 来检查proj 是否存在，我需要将proj.pc 的路径添加到pkgconfig 检查的位置。

之后

export PKG_CONFIG_PATH=${PKG_CONFIG_PATH}:/home/directory/local/proj_install/lib/pkgconfig

install.packages("sf", configure.args="--with-proj-include=/home/directory/local/proj_install/include --with-proj-lib=/home/directory/local/proj_install/lib --with-proj-data=/home/directory/local/proj_install/share/proj")

工作正常。