为什么 GADM SpatialPolygonsDataFrame 的图未在 R 中加载？

Question

单线： R 绘制 SpatialPolygonsDataFrame 花费的时间太长，我在网上找到的最佳答案是问题是特定于机器的。

问题：我正在尝试绘制从 GADM 下载的印度 SpatialPolygonsDataFrame（级别 = 1），但没有绘图功能（spplot、plot、tm_shape）在任何给定时间；相反，R 似乎在后台工作，但 5 分钟后仍然没有情节。按下控制台上方出现的停止按钮没有任何作用，最终为了重试其他方法，我必须强制退出应用程序。我的问题与this question 类似，但对该问题的共识是该问题出现在机器特定的情况下，此后没有解决方案。

以下是有关我的机器/R studio 版本的一些信息： R 版本 3.3.2 (2016-10-31) / R Studio 版本 1.0.136 / 操作系统：MacOS Sierra 版本 10.12.6。

文件下载自：GADM，RDS 格式

(1.) 我尝试了不同的绘图机制

setwd("~/Data/Reference/")
india <- readRDS("IND_adm1.rds")

library(sp)
library(tmap)

# Plot method #1 
plot(india)

# Plot method #2
spplot(india, "NAME_1")

# Plot method #3
tm_shape(india) + tm_borders()

(2.) 我尝试从 shapefile 而不是 RDS 重新创建 SpatialPolygonsDataFrame

india <- readOGR(dsn = "~/Data/Reference/" , layer = "IND_adm1")

(3.)我已经更新了机器上的所有包，卸载并重新安装了sp包和tmap包。

(4.) 我尝试了其他国家的文件并遇到了同样的问题。

(5.) 我检查了 SpatialPolygonsDataFrame 的结构，并没有发现任何问题 - 一切似乎都已到位且方式正确。

(6.) 使用 maps 包来绘制他们的数据工作正常。由于某种原因，SpatialPolygonsDataFrame 类没有绘制。我现在也尝试从DIVA-GIS 绘制形状文件。

library(maps)
tx <- map("county", "texas", plot = FALSE, fill = TRUE)
plot(tx) # this plots fine and immediately

要求我基本上需要一张印度的州界地图，我可以将其放入闪亮的交互式 RMarkdown 报告中，并根据因子变量填充州颜色。有一些我可以使用的数据的解决方法吗？

问：我不知道该怎么做或如何进一步诊断。如果有帮助，我将不胜感激，并乐于提供更多信息。我还链接了exact RDS file that I'm using 供您加载并在您的机器上试用。

更新 建议的解决方案都不适用于我的系统，但我认为我遇到的这个挑战是特定于系统的。我最终尝试在 Amazon Web 服务上的远程 Windows 实例上运行相同的代码，并且代码运行良好。所以我不确定这是 Mac 问题还是硬件问题，但我希望此更新对您有所帮助。

Answer 1

我在 Mac 上遇到这个问题已经有一段时间了，在寻找解决方案时，在 R Bloggers 上找到了这个问题。该代码简化了 shapefile，使其能够更轻松地绘图：

library("shapefiles")

map = readOGR(dsn = "shp", layer = "shp")

for(i in 1:length(map@polygons)){
  for(j in 1:length(map@polygons[[i]]@Polygons)){
    temp <- as.data.frame(map@polygons[[i]]@Polygons[[j]]@coords)
    names(temp) <- c("x", "y")
    temp2 <- dp(temp, 0.01)
    map@polygons[[i]]@Polygons[[j]]@coords <- as.matrix(cbind(temp2$x, temp2$y))
  }
}

plot(map, col = "black")

(http://www.r-bloggers.com/simplifying-polygon-shapefiles-in-r/)。

然而，虽然这有助于绘图过程，但由于其简化的形式，尝试对新 shapefile 执行 GIS 操作变得很麻烦。

值得从 GADM 以外的网站查找国家/地区 shapefile。例如，我从这个站点使用的所有 shapefile 都可以毫不费力地立即在我的 Mac 上绘制：http://mapeastafrica.com/countries/east-africa-shapefiles/。