【问题标题】:Error installing etetoolkit. When installing using anaconda安装 etetoolkit 时出错。使用 anaconda 安装时
【发布时间】:2019-12-25 00:55:25
【问题描述】:

我跟着directions安装了etetoolkit for mac。

# Install Minconda  (you can ignore this step if you already have Anaconda/Miniconda)
curl -L 'http://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh' -o Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh -b -p ~/anaconda_ete/
export PATH=~/anaconda_ete/bin:$PATH;

# Install ETE and external tools 
conda install -c etetoolkit ete3 ete_toolchain

# Check installation
ete3 build check

我在运行conda install -c etetoolkit ete3 ete_toolchain 时遇到错误

错误:

UnsatisfiableError: 以下规格被发现是 与您现有的 python 安装不兼容 环境:

  • ete3 -> python[version='>=2.7,=3.5,=3.6,
  • ete_toolchain -> python[version='>=2.7,=3.5,=3.6,

【问题讨论】:

    标签: python anaconda etetoolkit


    【解决方案1】:
    1. 我为 anaconda 3.7 运行了 [包安装程序][2]。 (我认为我实际上不必这样做。)
    2. 从终端运行:conda install python=2.7
    3. 然后conda install -c etetoolkit ete3 ete_toolchain

    然后我通过运行ete3 build check 验证了它是否有效。在显示的结果中clustalo: MISSING,但这是一个需要解决的新问题。

    更新

    运行conda install -c etetoolkit ete3_external_apps解决了最后的问题

    ete3 给出的指令中有一个type-o。改用这个。

    【讨论】:

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