在文本文件中查找与行匹配的文件名答案

【问题标题】：Find filenames matching lines in a text file在文本文件中查找与行匹配的文件名
【发布时间】：2020-03-03 00:31:57
【问题描述】：

我有一个文本文件如下：

orthogroup1
orthogroup4
...

我有一个包含如下文本文件的目录：

orthogroup1.faa.reconciled
orthogroup2.faa.reconciled
orthogroup3.faa.reconciled
orthogroup4.faa.reconciled
...

我想使用文本文件在我的目录中获取相应的文件名。

结果应该是这样的：

orthogroup1.faa.reconciled
orthogroup4.faa.reconciled

我该怎么做？

提前谢谢:)

【问题讨论】：

stackoverflow.com/help/on-topic

标签： unix

【解决方案1】：

你能定义“获取我的目录中的文件名”是什么意思吗？你对他们有什么下一步计划？

似乎您可能想使用sed 或awk 之类的东西，尽管后者可能有点矫枉过正。请参阅What is the difference between sed and awk? 了解更多信息。

【讨论】：

【解决方案2】：

grep 的-f 选项允许您从文件中获取模式。在find 的输出上使用它来过滤掉列表：

find /path/to/dir -type f | grep -f /path/to/patterns

【讨论】：

啊，好吧，我以为这就是你想要的。
好吧，如果您可以控制要匹配的文件列表，您可以编辑（或生成）它，以便每行以\. 结尾，如orthogroup1\. 等等。这将匹配第一个点分隔符。
你知道我现在如何将上面命令的输出复制到一个新的/不同的目录吗？非常感谢你:)
如果您指的是文本列表，只需使用重定向运算符：find /path/to/dir -type f | grep -f /path/to/patterns > /path/to/list/of/matches
我的目标是移动实际文件，这可能吗？

【解决方案3】：

类似这样的：

suffix='.faa.reconciled'
for line in $(cat file.txt); do
    echo $line$suffix
done

例子：

$ cat file.txt
orthogroup1
orthogroup4

$ ls -l ortho*
orthogroup4.faa.reconciled
orthogroup3.faa.reconciled
orthogroup2.faa.reconciled
orthogroup1.faa.reconciled

$ suffix='.faa.reconciled'; for line in $(cat file.txt); do echo $line$suffix; done
orthogroup1.faa.reconciled
orthogroup4.faa.reconciled

【讨论】：