tiff 堆栈的阈值查看整个堆栈而不是单个 tiff 图像

Question

我有一个 tiff 堆栈（黑白），当我在 imageJ 中打开堆栈中的单个图像时，对比度是完美的，但是，当我打开整个堆栈（移动物体的图像序列）时，对比度很糟糕对于最后的幻灯片（当然，荧光已经漂白了）。在 Matlab 或 imageJ 中是否有办法确保对比度不是由整个堆栈决定，而是由堆栈中的单个图像决定（这样亮度的变化就不再存在了）。

让我知道如何更好地解释。这是一个非常简单的问题，但我不知道没有看到它是多么容易理解。

谢谢

Answer 1

要纠正随时间推移的荧光信号漂白，请考虑将 bleach corrector plugin 用于 ImageJ。 在 ImageJ 中对堆栈进行阈值处理时，您可以分别计算每个切片的阈值：

• 图像 > 调整 > 阈值...

• 不选中堆栈直方图，以预览基于当前切片计算的阈值
• 点击应用

• 在对话框中，选择计算每个图像的阈值，将选择的阈值方法分别应用于每个堆栈切片。

为了获得此过程的宏源代码，请在开始前通过插件> 宏> 记录... 启动ImageJ macro recorder。