【发布时间】：2014-01-23 11:01:11
【问题描述】：
我正在使用 python 研究 SVM（支持向量机）。
我的输入是 pdb 文件。我已经看到了许多使用数据集的示例。但是，就我而言，我想解析蛋白质的 3d 结构（.pdb 文件）。
如何从 pdb 获取 svm？
【问题讨论】：
标签： python svm libsvm svmlight
【发布时间】：2014-01-23 11:01:11
【问题描述】：
SVMa 设计用于处理数字。蛋白质 3d 结构远非如此。可能的选择很少：
- 创建某种固定长度的数字表示，这在化学信息学中称为fingerpint，包括数十种现有方法，即。克莱科塔FP； PubChemFP、subFP 等
- 使用为此类结构（如标记图）开发的 custrom 内核，其中一个此类内核是用于化学信息学的图形内核，即。 chemcpp中包含的那些
【讨论】：