从 R 调用时 h2o 连接失败：Java 版本不匹配

Question

h2o 之前在我的笔记本电脑上工作过，但我有一段时间没有使用它 （并且同时安装了新的软件包和更新的东西）。昨天我尝试使用它，但它没有工作。我删除了 R h2o 打包并从头开始重新安装 h2o

install.packages("h2o")

我尝试用h2o.init() 运行h2o，但它给了我这个错误

java version "9"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 9+181)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 9+181, mixed mode)

Starting H2O JVM and connecting: ............................................................ 
[1] "localhost"
[1] 54321
[1] TRUE
[1] -1
[1] "Failed to connect to localhost port 54321: Connection refused"
  % Total    % Received % Xferd  Average Speed   Time    Time     Time  Current
                                 Dload  Upload   Total   Spent    Left  Speed
  0     0    0     0    0     0      0      0 --:--:-- --:--:-- --:--:--     0curl: (7) Failed to connect to localhost port 54321: Connection refused
[1] 7
Error in h2o.init() : H2O failed to start, stopping execution.

当我查看它显示的错误日志时

Only Java 1.6-1.8 supported, version is 9

我试图寻找更多信息，我认为错误是由第 1836 行的this code 触发的：

if (version != null && !(version.startsWith("1.6") || version.startsWith("1.7") || version.startsWith("1.8"))) {
  System.err.println("Only Java 1.6-1.8 supported, version is " + version);
  return true;

看来h2o 正在检查以 1.6、1.7 和 1.8 开头的版本，但我的版本出于某种原因以 9 开​​头！ 但是，在终端上，java -version 给出了

openjdk version "1.8.0_121"
OpenJDK Runtime Environment (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 1.8.0_121-b15)
OpenJDK 64-Bit Server VM (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 25.121-b15, mixed mode)

而which java 给了

/Users/myusername/anaconda3/bin/java

------------ 编辑 -------

更多信息：/usr/libexec/java_home -V 给予

Matching Java Virtual Machines (4):
    9, x86_64:  "Java SE 9" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.jdk/Contents/Home
    1.8.0_144, x86_64:  "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_144.jdk/Contents/Home
    1.8.0_51, x86_64:   "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_51.jdk/Contents/Home
    1.8.0_25, x86_64:   "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home

这解释了h2o 看到的9。我觉得它期望 1.x.0 但版本只是 9 很奇怪。无论如何，似乎我需要将h2o.init() 命令指向1.8 java，但我不知道该怎么做。

我通常使用brew 来安装大多数东西，但我从不使用java，所以我对版本一无所知。

谢谢，最好的！

Answer 1

我关注了in this thread 的讨论以找到问题的解决方案，尽管这对某些人来说并不方便。

默认java 是1.8.x，因此一旦h2o 可以使用，但从R 调用h2o 会导致版本9 java 被调用。

目前（相当不完整的）解决方案是像这样从终端启动h2o 服务器

cd h2o-3.14.0.3   #navigate to wherever you have the h2o installation
java -jar h2o.jar

运行良好，然后我从R 链接它而不启动h2o 实例：

h2o.init(startH2O = FALSE) 

如果您可以从终端启动h2o，这可以正常工作（如果您在集群上工作，这可能是唯一的方法），但如果您想从RStudio 启动它可能会很烦人对离开。

Answer 2

你报告的错误说：

仅支持 Java 1.6-1.8，版本为 9

好像您安装了 Java 9，但 H2O 尚不支持。使用兼容的 Java 版本，这将修复错误。

如果您不能或不想卸载 Java 9，那么您需要通过设置 JAVA_HOME 环境变量来告诉 H2O 您想使用哪个 Java。首先，通过在 shell 中执行以下命令来获取 Java 1.8 的位置：

/usr/libexec/java_home -v 1.8

在我的 Mac 上，它显示了这个：

/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_45.jdk/Contents/Home

您可以通过运行以下命令检查 R 是否可以看到您的 JAVA_HOME 变量：Sys.getenv("JAVA_HOME")。

如果它是空白的（如果您使用 RStudio，则可能是空白），那么必须做更多的工作才能让 R 看到 JAVA_HOME 变量。您可以编辑~/.Renviron 文件以添加JAVA_HOME=/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_45.jdk/Contents/Home 或您机器上的任何位置。然后重新启动 RStudio，它应该可以工作了。