【发布时间】：2013-04-24 17:36:12
【问题描述】：
我正在尝试对坐标列表进行聚类分析。我想使用 scipy.cluster.hierarchy.fclusterdata。如何从我的坐标创建适当的 n x m 数据矩阵？
我的列表如下所示：
list=[[1,2],[3,4],[5,6]]
【问题讨论】：
标签： python scipy distance cluster-analysis
【发布时间】：2013-04-24 17:36:12
【问题描述】：
根据documentation，fclusterdata 采用形状为 (n, m) 的数组，其中 n 是观察数，m 是给定数据点的维度。
如果您将您的列表传递给numpy.array，则数据将以正确的形状排列。
>>> np.array([[1, 2], [3, 4], [5, 6]]).shape
(3, 2)
【讨论】：
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谢谢。我试图在列表上运行 scipy.cluster.hierarchy.fclusterdata：spcluster.hierarchy.fclusterdata(list,10.0,method='ward') 但我收到以下错误：文件“/appl64/python2.7.3/lib/python2 .7/site-packages/scipy/cluster/hierarchy.py”，第 623 行，在链接中 raise ValueError(“当原始观察结果为时的有效方法” ValueError：当原始观察结果被省略时，有效方法是 'single'、'complete '、'加权'和'平均'。我现在做错了什么？
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什么是
list？那应该是你的 numpy 数组形式的数据，你绝对不应该将该变量命名为list。 -
对不起，这是我的数据（以正确的形式），并且在实际程序中它的名称是适当的。我只是以“列表”为例
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不确定。不过，其他人似乎也遇到了类似的问题：projects.scipy.org/scipy/ticket/1272