R列中的时间序列层次聚类答案

【问题标题】：Time Series Hierarchical Clustering in R column-wiseR列中的时间序列层次聚类
【发布时间】：2017-12-31 23:41:11
【问题描述】：

我正在尝试使用 tsclust 进行时间序列聚类，我的数据集如下所示：

我有超过 500 个时间序列，每个时间序列有 8 个观测值在同一时间线上。我将 tsclust 应用于它，但按时间而不是按系列获得集群（如下所示）：

后来我发现 tsclust 只能按行工作。（来自 www.rdocumentation.org/packages/dtwclust/versions/3.1.1/topics/tsclust）

是否还有其他类似的函数可以用来完成聚类分析？或者我怎样才能改变我的数据格式来做到这一点？

我的原始代码如下所示：

tst<-read.csv("data.csv", stringsAsFactors = TRUE)
tst<-xts(tst[,-1], order.by = as.Date(paste0(tst[,1])))

par(mar=c(1,1,1,1))
plot.xts(tst)

series <- zscore(tst)

hc.sbd <- tsclust(series, type = "h", k = 6L,
              preproc = zscore, seed = 233,
              distance = "sbd", centroid = shape_extraction,
              control = hierarchical_control(method = "average"))
plot(hc.sbd)
plot(hc.sbd, type = "sc")

感谢任何帮助。提前谢谢你。

【问题讨论】：

需要注意的是，您使用的是 dtwclust 包中的 tsclust 函数，而不是 TSclust 包。您是否尝试过转置数据？参见 R 中的 ?t。
@Jay 只需将 t 应用于我的系列即可。非常感谢！！！！！！

标签： r time-series cluster-analysis hierarchical-clustering tsclust

【解决方案1】：

使用t转置您的数据。

将列转换为行。

【讨论】：