【问题标题】:PYMC MAP Fit problemsPYMC MAP 拟合问题
【发布时间】:2015-06-20 12:07:41
【问题描述】:

我使用 PyMC 来实现多项式-狄利克雷对。我想为我们拥有的所有实例映射模型。 我面临的问题是,一旦 MAP.fit() 更改了先前的分布。因此,对于每个新实例,我都需要有一个新的先验分布,这应该没问题。但是,我一直看到这个错误:

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/xingweiy/Project/StarRating/TimePlot/BayesianPrediction/DiricheletMultinomialStarRating.py", line 41, in <module>
    prediction = predict.predict(input,prior)
  File "/Users/xingweiy/Project/StarRating/TimePlot/BayesianPrediction/predict.py", line 12, in predict
    likelihood = pm.Categorical('rating',prior,value = exp_data,observed = True)
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pymc-2.3.4-py2.7-macosx-10.9-intel.egg/pymc/distributions.py", line 3170, in __init__
    verbose=verbose, **kwds)
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pymc-2.3.4-py2.7-macosx-10.9-intel.egg/pymc/PyMCObjects.py", line 772, in __init__
    if not isinstance(self.logp, float):
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pymc-2.3.4-py2.7-macosx-10.9-intel.egg/pymc/PyMCObjects.py", line 929, in get_logp
    raise ZeroProbability(self.errmsg)
pymc.Node.ZeroProbability: Stochastic rating's value is outside its support,
 or it forbids its parents' current values.

代码如下:

alpha= np.array([0.1,0.1,0.1,0.1,0.1])
prior = pm.Dirichlet('prior',alpha)
exp_data = np.array(input)
likelihood = pm.Categorical('rating',prior,value = exp_data,observed = True)
MaximumPosterior = inf.inference(prior, likelihood, exp_data)

def inference(prior,likelihood,observation):
    model = Model({'likelihood':likelihood,'prior':prior})
    M = MAP(model)
    M.fit()
    result = M.prior.value
    result = np.append(result,1- np.sum(M.prior.value))
    return result

我认为这是 pymc 包的错误。有没有办法在不改变先前分布的情况下做 MAP?

谢谢

下面链接中的答案解决了我的问题:

https://groups.google.com/forum/#!topic/pymc/uYQSGW4acf8

【问题讨论】:

  • 你能展示你的模型输入吗?
  • 它只是一个整数列表,例如[1,5,1,5,3,4]。每个实例都是一个 1 到 10 之间的整数列表。但列表的大小可能不同。
  • 顺便说一句,如果我不为每个实例提供新的先验,程序可以毫无问题地运行。但是,结果是错误的,因为在 MAP.fit() 之后更改了先验分布
  • 如果您显示完整的代码,我们将更容易重现您的错误。

标签: python pymc


【解决方案1】:

基本上,狄利克雷分布产生的概率接近于 0。

下面的链接解决了我的问题: https://groups.google.com/forum/#!topic/pymc/uYQSGW4acf8

【讨论】:

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