pymc 库的问题答案

【问题标题】：Trouble with pymc librarypymc 库的问题
【发布时间】：2013-11-26 17:54:59
【问题描述】：

我正在尝试运行以下代码：

import pymc as pm

alpha = 1.0/count_data.mean() #count_data is the variable that holds txtc
lambda_1 = pm.Exponential("lambda_1", alpha)
lambda_2 = pm.Exponential("lambda_2", alpha)

tau  = pm.DiscreteUniform("tau", lower=0, upper=n_count_data)

并不断收到此错误：

RuntimeError: module compiled against API version 9 but this version of numpy is 6
Traceback (most recent call last):
File "bayestest.py", line 1, in <module>
import pymc as pm
File "/Library/Python/2.7/site-packages/pymc-2.3-py2.7-macosx-10.8-intel.egg/pymc/__init__.py", line 29, in <module>
from .CommonDeterministics import *
File "/Library/Python/2.7/site-packages/pymc-2.3-py2.7-macosx-10.8- intel.egg/pymc/CommonDeterministics.py", line 21, in <module>
from .utils import safe_len, stukel_logit, stukel_invlogit, logit, invlogit, value,  find_element

文件“/Library/Python/2.7/site-packages/pymc-2.3-py2.7-macosx-10.8-intel.egg/pymc/utils.py”，第 14 行，来自 .导入 flib ImportError: numpy.core.multiarray 导入失败

我的库安装版本有问题吗？

【问题讨论】：

错误的第一行似乎很清楚：RuntimeError: module compiled against API version 9 but this version of numpy is 6. You need to upgrade your numpy library.
你是怎么安装的？

标签： python numpy pymc

【解决方案1】：

我认为 OP 应该接受上面 Chris Fonnesbeck 的答案。

PyMC 安装试图找到一个 numpy 安装并遇到了 OS X 附带的 numpy 版本，因此觉得它太过时了，无法使用。并不是因为那个版本的 numpy 不好——事实上，它在分发之前已经对系统的所有其他组件进行了广泛的测试，只是 PyMC 需要更新的功能。

在我个人看来，最简单的方法是安装Anaconda，并允许它在你的系统中注册。

编辑：在这里了解了一下礼仪，意识到我不应该添加答案而是评论 - 但是，我还没有特权。

【讨论】：

【解决方案2】：

如果您在 OS X 上，确保您的 Python 科学软件包都兼容的简单方法是简单地安装我的Scipy Superpack，或者如果您不介意在您的系统上安装第二个 Python，安装Anaconda.

【讨论】：