【问题标题】:Lmfit separate peak fittingLmfit 分离峰拟合
【发布时间】:2016-10-01 06:54:39
【问题描述】:

我对曲线/峰值拟合非常陌生,但我正在尝试拟合具有多个独立峰值的数据集。我尝试了类似于 lmfit 提供的示例的方法,这是我的代码:

import matplotlib.pyplot as plt
from lmfit.models import GaussianModel
from numpy import loadtxt

data = loadtxt('079-55.freq')
x = data[:, 0]
y = data[:, 1]

gauss1 = GaussianModel(prefix='g1_')
pars = gauss1.make_params()
pars['g1_center'].set(4100, min=2000, max=4500)
pars['g1_amplitude'].set(170, min=10)

gauss2 = GaussianModel(prefix='g2_')
pars.update(gauss2.make_params())
pars['g2_center'].set(4900, min=4500, max=5500)
pars['g2_amplitude'].set(30, min=10)

gauss3 = GaussianModel(prefix='g3_')
pars.update(gauss3.make_params())
pars['g3_center'].set(600, min=5500, max=10000)
pars['g3_amplitude'].set(13, min=10)

mod = gauss1 + gauss2 + gauss3

init = mod.eval(pars, x=x)
plt.plot(x, init, 'k--')

out = mod.fit(y, pars, x=x)

print(out.fit_report())

plt.plot(x, out.best_fit, 'r-')
plt.plot(x, y)
plt.show()

但是,结果变成了这样:

我很困惑如何继续拟合三个单独的峰,如下所示。我认为参数更新是为了将多个模型放入同一个数据集中,而不是为了单独的独立峰。不过我可能是错的。有什么建议吗?

【问题讨论】:

  • 你能提供数据吗?
  • 我建议从一个更简单的模型开始,比如 1 Gaussian,然后查看最初猜测的值和改进后的值。然后,添加第二个高斯。

标签: python-2.7 lmfit


【解决方案1】:
pars['g3_center'].set(600, min=5500, max=10000) 

可能会混淆参数或模型类,因为 600 不在最小值和最大值的范围内。

【讨论】:

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