【发布时间】:2021-12-25 13:03:01
【问题描述】:
我正在尝试使用代码保存包含标签 [0,1,2] 的掩码:
for img in range(len(t2_list)): #Using t1_list as all lists are of same size
print("Now preparing image and masks number: ", img)
temp_image_t2=nib.load(t2_list[img]).get_fdata()
temp_image_t2=scaler.fit_transform(temp_image_t2.reshape(-1, temp_image_t2.shape[-1])).reshape(temp_image_t2.shape)
temp_mask=nib.load(mask_list[img]).get_fdata()
temp_mask=temp_mask.astype(np.uint8)
print(np.unique(temp_mask))
val, counts = np.unique(temp_mask, return_counts=True)
if (1 - (counts[0]/counts.sum())) > 0.01: #At least 1% useful volume with labels that are not 0
print("Save Me")
temp_mask= to_categorical(temp_mask, num_classes=2)
np.save('/content/drive/MyDrive/input_data_3channels/images/image_'+str(img)+'.npy', temp_combined_images)
np.save('/content/drive/MyDrive/input_data_3channels/masks/mask_'+str(img)+'.npy', temp_mask)
else:
print("nope”)
即使数组包含 [0 1 2],这也会导致无法解决此问题:
现在准备图像和蒙版数量:20 [0 1] 没有 现在准备图像和蒙版编号:21 [0 1] 没有 现在准备图像和蒙版数量:22 [0 1] 没有 现在准备图像和蒙版数量:23 [0 1] 没有 现在准备图像和蒙版数量:24 [0 1] 没有 现在准备图像和蒙版数量:25 [0 1] 没有 现在准备图像和蒙版数量:26 [0 1 2] 没有 现在准备图像和蒙版数量:27 [0 1] 没有 现在准备图像和蒙版编号:28
【问题讨论】:
标签: numpy tensorflow 3d