sklearn“numpy.dtype 的大小错误，请尝试重新编译”在 pycharm 和终端中答案

【问题标题】：sklearn "numpy.dtype has the wrong size, try recompiling" in both pycharm and terminalsklearn“numpy.dtype 的大小错误，请尝试重新编译”在 pycharm 和终端中
【发布时间】：2016-11-06 21:59:06
【问题描述】：

在编译 Sci-kit 学习时，我在 pycharm 和终端中都得到“numpy.dtype 的大小错误，请尝试重新编译”。我已经升级了所有的包（numpy，scikit 到最新的），没有用。Python 版本是 2.7。请帮忙。欣赏！

    checking for nltk
    Traceback (most recent call last):
    File "startup.py", line 6, in <module>
    import nltk
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/nltk/__init__.py", line 128, in <module>
      from nltk.chunk import *
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/nltk/chunk/__init__.py", line 157, in <module>
   from nltk.chunk.api import ChunkParserI
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/nltk/chunk/api.py", line 13, in <module>
    from nltk.parse import ParserI
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/nltk/parse/__init__.py", line 79, in <module>
    from nltk.parse.transitionparser import TransitionParser
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/nltk/parse/transitionparser.py", line 21, in <module>
    from sklearn.datasets import load_svmlight_file
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/__init__.py", line 57, in <module>
    from .base import clone
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/base.py", line 11, in <module>
    from .utils.fixes import signature
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/utils/__init__.py", line 10, in <module>
    from .murmurhash import murmurhash3_32
  File "numpy.pxd", line 155, in init sklearn.utils.murmurhash (sklearn/utils/murmurhash.c:5029)
ValueError: numpy.dtype has the wrong size, try recompiling

【问题讨论】：

你是如何安装 scikit 和 numpy 的？
我的猜测是您已经通过包管理器（pip？conda？）安装了 sklearn，并且您使用的是系统的默认 numpy 安装。它应该由pip install --upgrade scikit-learn numpy 修复（其他包管理器类似）。

标签： python numpy scikit-learn

【解决方案1】：

当您使用不兼容的版本时会出现此问题。使用以下命令检查版本：

pip freeze

或者，对于特定的模块

pip freeze | grep Module_Name

我通过更新所有包来解决我的问题：

pip install -U scikit-learn numpy scipy pandas matplotlib

截至今天（2016 年 11 月 30 日）。这些版本是兼容的：

matplotlib==1.5.2
nltk==3.2.1
numpy==1.11.2
pandas==0.19.1
scikit-learn==0.18.1
scipy==0.18.1
textblob==0.11.1

【讨论】：

【解决方案2】：

“numpy.dtype 的大小错误，请尝试重新编译”错误意味着 sklearn 是针对比 sklearn 现在尝试导入的 numpy 版本更新的 numpy 编译的。要解决此问题，您需要确保 sklearn 是针对它现在正在导入的 numpy 版本或早期版本编译的。详细解释见ValueError: numpy.dtype has the wrong size, try recompiling。

我从你的路径猜想你正在使用 OSX 系统 Python（OSX 附带的那个，/usr/bin/python）。 Apple 已经修改了这个 Python，使其选择了自己的 numpy 版本，而不是您使用 pip 等安装的任何版本 - 请参阅 https://github.com/MacPython/wiki/wiki/Which-Python#system-python-and-extra-python-packages 。我强烈建议您切换到 Python.org 或 homebrew Python，以便更轻松地使用依赖于 numpy 的包。

【讨论】：