使用python打开.mat（matlab数据）

Question

全部，

我尝试从 python 导入和读取 .mat 文件。我尝试了两种方法，但都不成功：

方法一： 在python中：

 import scipy.io as sio    
mat = sio.loadmat('path/tmpPBworkspace.mat')

我收到类似于以下内容的消息：

{'None': MatlabOpaque([ (b'rateQualityOutTrim', b'MCOS', b'dataset', array([[3707764736],
        [         2],
        [         1],
        [         1],
        [         1],
        [         1]], dtype=uint32))],
              dtype=[('s0', 'O'), ('s1', 'O'), ('s2', 'O'), ('arr', 'O')]),
 '__function_workspace__': array([[ 0,  1, 73, ...,  0,  0,  0]], dtype=uint8),
 '__globals__': [],
 '__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: GLNXA64, Created on: Thu May 10 07:11:52 2018',
 '__version__': '1.0'}

我不确定那里出了什么问题？我希望看到一个数据框

还要补充一点，在方法 1 中，我已将 .mat 保存在与 scipy 兼容的版本中

在 Matlab 中

save('path/tmpPBworkspace.mat','rateQualityOutTrim','-v7')

也尝试了另一种方式：

方法二：h5py

在 Matlab 中：

save('path/tmpPBworkspaceH5.mat','rateQualityOutTrim','-v7.3')

在 Python 中：

import numpy as np
import h5py
f = h5py.File('/GAAR/ustr/projects/PBF/tmpPBworkspaceH5.mat','r')
data = f.get('rateQualityOutTrim/date')
data = np.array(data)

我明白了

f
Out[154]: <HDF5 file "tmpPBworkspaceH5.mat" (mode r)>

data
array(None, dtype=object)

数组为空。不知道如何在这里访问数据

谢谢

Answer 1

我也会尝试使用 scipy.io：

我有一个 Matlab“结构”（Auslage_000.mat），我将其理解为某种嵌套字典。它有几个标题信息和三个数据通道（振动数据）。我还发现 spyder（Python 开发环境）很有帮助，因为一旦加载数据，您就可以通过变量管理器访问数据（类似于 Matlab）。

import scipy.io as sio

mat_contents = sio.loadmat('Auslage_000.mat',squeeze_me=True,struct_as_record=False)

当我检查变量“mat_contends”的输出时，我得到了

mat_contents

Out[14]: 
{'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: PCWIN, Created on 2019-08-14 13:14:56 by TiePie software (www.tiepie.com).',
 '__version__': '1.0',
 '__globals__': [],
 'tpd': <scipy.io.matlab.mio5_params.mat_struct at 0x1ea3441d438>}

我的实际数据在“tpd”中。我可以进一步访问数据如下：

#Access the data via the key 'tpd' and then the attribute 'Data'
# -> Data is a numpy array with 3 channels (ch1, ch2, ch3) / dimensions
Data = mat_contents['tpd'].Data

# extract channel1 

ch1 = Data[0]

我想你必须先挖掘一下，因为首先你的 Matlab 文件中有“键”和“属性”（如果它是一个结构）

Answer 2

您可以为此使用scipy.io.loadmat：

from scipy import io

loaded = io.loadmat('/GAAR/ustr/projects/PBF/tmpPBworkspaceH5.mat')

loaded 将是一个将名称映射到数组的字典。

---

但是，如果您同时控制 Matlab 部分和 Pandas 部分，则使用 csvwrite 会容易得多：

在 Matlab 中：

csvwrite('path/tmpPBworkspaceH5.csv','rateQualityOutTrim')

在 Python 中：

pd.read_csv('tmpPBworkspaceH5.csv')