从源代码安装 R 包时如何更改使用的 C++ 版本编译器？答案

【问题标题】：How to change which C++ version compiler is used when installing an R package from source?从源代码安装 R 包时如何更改使用的 C++ 版本编译器？
【发布时间】：2020-09-20 10:47:08
【问题描述】：

我正在尝试使用 remotes::install_github("pkgname") 从源代码安装 R 包。我收到以下错误：

/bin/sh: /usr/local/Cellar/gcc/9.2.0/bin/g++-7: No such file or directory

我检查了，我有 g++-9 代替。我一直在寻找一种方法来更改设置以指向正确的路径，但到目前为止还没有运气。我什至不确定要查看哪个包或是否要处理 R 配置文件。任何帮助将不胜感激。

我在 Mac OSX 10.15.5 (Catalina) 上使用 R 版本 3.6.3。我安装了 XCode 开发人员工具，但每当我运行检查时，RStudio 都会建议我安装它们，就好像它找不到一样。

非常感谢

【问题讨论】：

标签： r package rcpp

【解决方案1】：

按照您的建议，R 似乎看不到您的 g++ 编译器。

1 检查 g++ 是否在 PATH 上 您是否使用自制软件安装了 R？由于错误路径指向 /usr/local/Cellar，似乎就是这种情况。

您可以通过在 Mac OS 上打开终端程序并键入以下内容来查看 g++ 编译器是否在路径上：

echo $CXX

如果它返回 null（或什么都没有），那么路径上没有任何内容。

2 在 brew 中安装 g++ 让我们在 brew 中安装 g++。打开终端并运行以下命令，在每一行后按回车键：

brew update
brew install gcc48
brew doctor

在此之后，请重新启动您的计算机。

3 检查 g++ 现在是否在 PATH 上

在终端上再次运行echo $CXX。如果这仍然不起作用，请查看当前问题：

https://github.com/r-lib/rlang/issues/754

我建议如果这不起作用，请尝试再次安装 XCode 开发人员工具。你可以这样做：

xcode-select --install

【讨论】：

我已经重新安装了 xcode 开发者工具，但问题依然存在。这让我觉得它们的安装方式可能存在问题。我已经更改了 R 项目配置文件，所以现在它找到了实际的编译器链接，但这似乎是一种解决方法，而不是修复实际问题（库开始安装，但我将不得不进行很多失败现在挖掘）。感谢您的建议！

【解决方案2】：

除了@bats_n_stats（很棒！）所写的内容之外，还有以下内容：

每个 Rcpp 的使用都是由 R 本身驱动的

R 可以通过R CMD config 调用告诉我们它使用了什么。在我的系统上

edd@rob:~$ R CMD config CXX
ccache g++
edd@rob:~$

意思是g++（无限定版本）的（标准）值与ccache提供的加速缓存结合使用（不同的主题，我过去写过博客）

您也可以通过grep 在实际的配置文件中查看（我直接在下面查找）

edd@rob:~$ grep ^CXX $(R RHOME)/etc/Makeconf
CXX = g++ -std=gnu++11
CXXCPP = $(CXX) -E
CXXFLAGS = -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-Do_dS_/r-base-4.0.0=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g $(LTO)
CXXPICFLAGS = -fpic
CXX11 = g++
CXX11FLAGS = -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-Do_dS_/r-base-4.0.0=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g $(LTO)
CXX11PICFLAGS = -fpic
CXX11STD = -std=gnu++11
CXX14 = g++
CXX14FLAGS = -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-Do_dS_/r-base-4.0.0=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g $(LTO)
CXX14PICFLAGS = -fpic
CXX14STD = -std=gnu++14
CXX17 = g++
CXX17FLAGS = -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-Do_dS_/r-base-4.0.0=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g $(LTO)
CXX17PICFLAGS = -fpic
CXX17STD = -std=gnu++17
CXX20 = g++
CXX20FLAGS = -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-Do_dS_/r-base-4.0.0=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g $(LTO)
CXX20PICFLAGS = -fpic
CXX20STD = -std=gnu++2a
CXX_VISIBILITY = -fvisibility=hidden
edd@rob:~$

这个值 all 来自 R 本身构建时。因此，如果这对您的 Catalina 系统有影响，您需要查看您从哪里获得 R 以及那里可能出现的问题。使用 Cellar 暗示了 macOS 特定的内容，可能不是 https://mac.r-project.org/ 页面中建议的 R。

【讨论】：