如何从源代码安装 R 包？答案

【问题标题】：How do I install an R package from source?如何从源代码安装 R 包？
【发布时间】：2010-12-01 05:43:41
【问题描述】：

一位朋友在webscraping The New York Times with R 上向我发送了这个很棒的教程。我真的很想尝试一下。但是，第一步是从源代码安装一个名为 RJSONIO 的包。

我相当了解 R，但我不知道如何从源代码安装包。

我正在运行 Mac OS X。

【问题讨论】：

标签： r

【解决方案1】：

From CRAN，可以直接从 GitHub 仓库地址安装。所以如果你想要https://github.com/twitter/AnomalyDetection的包裹，使用

library(devtools)
install_github("twitter/AnomalyDetection")

成功了。

【讨论】：

【解决方案2】：

下载源码包，打开Terminal.app，导航到你当前有文件的目录，然后执行：

R CMD INSTALL RJSONIO_0.2-3.tar.gz

请注意，这只有在以下情况下才会成功：a) 软件包不需要编译或 b) 存在编译所需的系统工具。请参阅：R for Mac OS X

【讨论】：

我试过这个并得到一个错误：Madjoro-MacBook-Pro:~ Madjoro$ R CMD INSTALL RJSONIO_0.2-3.tar.gz 警告：无效的包'RJSONIO_0.2-3.tar。 gz' 错误：错误：未指定包
您必须指定 .tar.gz 文件的正确路径，并且需要 XCode 工具 (developer.apple.com/TOOLS/Xcode)。
有没有办法从源代码构建二进制 .zip？
找到解决方案，需要使用--binary选项。
您有多少次来这里是因为您输入的是 install 而不是 INSTALL？

【解决方案3】：

此外，您可以使用--binary 选项构建二进制包。

R CMD build --binary RJSONIO_0.2-3.tar.gz

【讨论】：

【解决方案4】：

如果您在本地有文件，则使用install.packages() 并设置repos=NULL：

install.packages(path_to_file, repos = NULL, type="source")

path_to_file 代表完整路径和文件名：

【讨论】：

【解决方案5】：

从源代码安装旧版本软件包的补充方便（但微不足道）提示。

首先，如果您调用“install.packages”，它总是从 repo 安装最新的包。如果你想安装旧版本的包，比如为了兼容性，你可以调用 install.packages("url_to_source", repo=NULL, type="source")。例如：

install.packages("http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/RNetLogo/RNetLogo_0.9-6.tar.gz", repo=NULL, type="source")

不用手动下载包到本地磁盘切换到命令行或者从本地磁盘安装，我觉得非常方便，并且简化了调用（一步）。

另外：您可以将此技巧与 devtools 库的 dev_mode 一起使用，以管理不同版本的包：

【讨论】：

【解决方案6】：

您可以直接从存储库安装（注意type="source"）：

install.packages("RJSONIO", repos = "http://www.omegahat.org/R", type="source")

【讨论】：

我试过这个并得到一个错误： * 安装 source 包 'RJSONIO' ... ** libs ** arch - i386 sh: make: command not found 错误：包 'RJSONIO' 的编译失败 RMate 在第 3 行停止 * 删除 '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.9/Resources/library/RJSONIO' 下载的包位于 '/private/var/folders/Ey/EyzhYjoKESmsmsZ6K87PeU +++TI/-Tmp-/Rtmpe3C96p/downloaded_packages' 更新 '.Library' 中包的 HTML 索引警告消息：在 install.packages("RJSONIO", repos = "omegahat.org/R", : 安装包 'RJSONIO'退出状态非零
您是否安装了开发者工具？它们包含在 Mac OS X 安装 DVD 中。由于这个包有 C 代码，你需要一个编译器来从源代码安装它。
我怀疑我没有安装开发者工具。至少，我不记得安装它们。谢谢！
如果您在 Windows 上执行此操作，您可以从 murdoch-sutherland.com/Rtools 获取开发人员工具...确保在安装时选中更新路径的框（可能有点难以阅读....刚刚选中出现的未选中框）