将 RMySQL 包添加到 R 失败（在 Windows 上）？

Question

我不知道为什么我的 RMySQL 包无法安装 - 这就是我得到的：

> install.packages('RMySQL',type='source')
trying URL 'http://cran.mirrors.hoobly.com/src/contrib/RMySQL_0.7-5.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 160769 bytes (157 Kb)
opened URL
downloaded 157 Kb

* installing *source* package 'RMySQL' ...
ERROR: configuration failed for package 'RMySQL'
* removing 'C:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/library/RMySQL'

The downloaded packages are in '(foo)'

Warning message:
In install.packages("RMySQL", type = "source") : installation of package 'RMySQL' had    non-zero exit status

我认为 MySQL 安装没有问题，因为正确的值似乎在注册表中：

> Sys.getenv('MYSQL_HOME')
                 MYSQL_HOME "C:/PROGRA~1/MySQL/MYSQLS~1.1/" 
> readRegistry("SOFTWARE\\MySQL AB", hive="HLM", maxdepth=2)
$`MySQL Server 5.1`
$`MySQL Server 5.1`$DataLocation
[1] "C:\\Documents and Settings\\All Users\\Application Data\\MySQL\\MySQL Server 5.1\\"

$`MySQL Server 5.1`$FoundExistingDataDir 
[1] "0"

$`MySQL Server 5.1`$Location 
[1] "C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.1\\"

$`MySQL Server 5.1`$Version
[1] "5.1.54"

困惑。任何帮助将不胜感激！

Answer 1

基本流程描述here，但有几个提示，所以我将描述整个解决方案（如果需要请更改R版本和路径）：

1. 从here 安装最新的 RTools
2. 安装 MySQL 或 mysql 的头文件和库文件
3. 创建或编辑文件C:\Program Files\R\R-2.12.1\etc\Renviron.site 并添加类似MYSQL_HOME=C:/mysql 的行（你的mysql 文件的路径）
4. 将 libmysql.lib 从 mysql/lib 复制到 mysql/lib/opt 以满足依赖关系。
5. 将 libmysql.dll 复制到C:\Program Files\R\R-2.12.1\bin 或windows/system32 目录。
6. 运行 install.packages('RMySQL',type='source') 并等待编译结束。

这在 Windows 7 64 位上对我有用，所以 32 位版本应该没有问题

最初发布here（类似问题）。

Answer 2

我遇到了这个在 Windows7 64 位下安装 RMySQL 的分步指南。

http://www.ahschulz.de/2013/07/23/installing-rmysql-under-windows/

我使用的软件有：

1. Windows 8 操作系统
2. R3.0.2 - 64 位
3. Rtools 3.1
4. MySQL 服务器社区版 5.6 - 64 位

按照上述指南（提供屏幕截图），我的 RMySQL 包的安装和加载工作正常。

非常感谢 Arne Hendrik Schulz！

Answer 3

以下在红帽 linux 中为我工作

wget http://cran.r-project.org/src/contrib/RMySQL_0.9-3.tar.gz
sudo R CMD INSTALL  --configure-args='--with-mysql-inc=/usr/include/mysql' --configure-args='--with-mysql-lib=/usr/lib64/mysql' RMySQL_0.9-3.tar.gz

Answer 4

18 个月后，新的笔记本电脑，同样的问题。回到犯罪现场——对不起 2011 年 1 月的自己；我们在未来，但这个安装仍然没有任何乐趣。

经验教训：

-更新的 RTools 是必不可少的。获取them。

-您是否看到类似于.onLoad failed in loadNamespace() for 'RMySQL', details 的错误？这似乎意味着您的系统环境变量存在问题。

在 R 中，运行

Sys.getenv('MYSQL_HOME')

如果它吐出类似的路径

 [1] "C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.6"

你很好。但如果它给你空字符串，你需要设置它。

这些都是 Windows 7 的方向，但如果没记错的话，过程在 XP 中非常相似。

1) 调出系统属性 > 高级 > 环境变量。

2) 在下方的“系统变量”窗格中，单击“新建”。

3) 变量名是MYSQL_HOME，值是你的MySQL安装路径——我的是C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6

较新版本的 MySQL 似乎没有在安装时创建环境变量 - 这和 RMySQL 缺乏二进制文件解释了为什么这个问题获得了 8,000 次点击。

-仍然卡住？以下是另外两篇深入的文章：1、2

Answer 5

我最近两天一直在用 RMySQL 包安装 R，终于找到了解决方案，这里是安装 RMySQL 包的步骤：-

1. 从以下链接下载软件： *一种。 R2.13.2：从http://cran.stat.sfu.ca/index.html下载R

     b. RTools 214:  Download RTools from http://cran.cict.fr
   
     c. RMySQL 0.8-0.tar.gz: Download RMySQL from 
     http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/main/RMySQL/RMySQL_0.8-0.tar.gz
   
     d. MySQL Server 5.0: download it from http://dev.mysql.com
   
     e. RSTUDIO (optional): download it from http://rstudio.org*
   

2. 设置以下环境变量

    * a. MYSQL_HOME : <drive>/path to MySQL installation folder
         e.g. MYSQL_HOME= C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\ 
   
     b. R_HOME: <drive>/path to R installation
        e.g. R_HOME=C:\Program Files\R\R-2.13.2\
   
     c. PATH: Modify path to accommodate the above variables. *
   

   确保您的 Windows PATH 变量中包含以下路径： \Rtools\2.14\bin \Rtools\2.14\MinGW\bin \Rtools\2.14\MinGW64\bin

3. 创建文件夹并复制文件

   一个。 OPT：在 C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\lib 下创建一个文件夹 OPT 并复制
   MYSQLLIB.LIB 上面的路径。还将 libmysql.dll 复制到 \\R\R-2.14.0\bin\（64 位）或 \\R\R-2.14.0\bin\i386\（32 位）和 C:\Windows\System32。

b. Renviron.site：创建或编辑文件 \\R\R-2.14.0\etc\Renviron.site 并添加一个 行：MYSQL_HOME =”C:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.5/” 注意：在此处使用正斜杠和双引号

c。 libMySQL.dll：将此文件复制到 C:\Program Files\R\R-2.13.2\bin\i386 以及 C:\Program 文件\R\R-2.13.2\bin

1. 运行命令

   一个。 Install.Packages：通过单击桌面上的 R 图标或从开始菜单运行 R GUI。类型 INSTALL.PACKAGES（“RMySQL”，类型=“来源”）。这将从存储库下载所需的软件。

b.命令提示符：复制下载的 zip 文件（在步骤 4.a.中）并将其粘贴到 R 下 安装文件夹。转到开始菜单并打开命令提示符。转到 R 安装文件夹并输入 R CMD INSTALL RMySQL_0.8-0.tar.gz

  *COMMANDS:
  >library(RMySQL)
   >drv = dbDriver("MySQL")
   >con = dbConnect(drv,host="localhost",dbname="test",user="root",pass="root")
   >album = dbGetQuery(con,statement="select * from t_master")
   >album*

Answer 6

将 MySQL 和 RTools 目录添加到 PATH！

这是我的路径; ~blah~;C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\bin;c:\rtools\bin;C:\Rtools\gcc-4.6.3\bin;

Answer 7

我创建了一个可能对人们有用的二进制文件：

http://kenahoo.blogspot.com/2011/09/rmysql-binary-for-windows-7.html

我基本上遵循了所有这些指示，包括范德比尔特页面上的指示，但出于某种原因，它似乎并不总是有效。无论如何，希望这对拥有与我使用的相同版本的东西的人有所帮助。

Answer 8

但是，您目前还有一个额外要求（使用 MySQL 服务器版本 5.5 和 R2.12.1），请按照当前 http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL 说明作为libmySQL.dll 与包中的预期不同。

即用于 64 位编译。 它期望 libmySQL.dll 位于 "${MYSQL_HOME}"/bin/libmySQL.dll 所以只需将 dll 复制到 /bin 目录，它现在就可以编译了。

用于 32 位编译。 libmySQL.lib 预计在 "${MYSQL_HOME}"/lib/opt/libmysql.lib 再次移动这应该可以解决问题。

或者，如果您不想或无法移动这些文件。然后您可以编辑源代码文件： Makevars.win Makevars.win32 Makevars.win64 适当地指向 /lib/libmysql.dll /lib/libmysql.lib

Answer 9

我在使用 R 2.12.1 x64 的 Windows 7 上遇到了同样的问题，并通过以下方式解决：

1. 将我的PATH 变量中的R 目录更改为C:\Program Files\R\R-2.12.1\bin\x64（而不仅仅是...\R-2.12.1\bin）。
2. 将...\MySQL Server 5.5\lib\libmysql.dll复制到...\MySQL Server 5.5\bin\。
3. 在 cmd.exe 中运行 R CMD INSTALL RMySQL_0.7-5.tar.gz（R 中的 install.packages('RMySQL',type='source') 仍然无法正常工作）。

Answer 10

正如马雷克所说。此软件包没有 Windows 二进制文件。当我尝试安装 RPostgreSQL（因为 Mac 没有二进制文件）时，我在我的 Mac 上遇到了类似的问题，最后我不得不自己编译它并修改几个文件。

对于 MySQL 部分（如果您对 MySQL 不太了解），您可能希望使用WAMP，这无疑超出了您的需要，但易于安装以及启动和关闭。

如需编译帮助，您可能对Rtools 感兴趣

HTH

顺便说一句：你运行什么样的窗口（对不起，如果我错过了）

Answer 11

首先我会尝试按照此页面上的说明进行操作：http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL

然后，确保您的计算机上确实有一个 MySQL 客户端，而不仅仅是服务器本身。我自己遇到了一个问题，我必须为客户端使用较旧的二进制文件，但您可以从 mysql 网站下载这些文件。