光栅化错误栏时的丑陋轮廓答案

【问题标题】：Ugly Outline When Rasterizing Errorbar光栅化错误栏时的丑陋轮廓
【发布时间】：2021-05-31 08:42:23
【问题描述】：

我正在使用 Matplotlib（版本 2.2.5）绘制大量有错误的数据点，并且我正在对数据进行栅格化，因为有几千个数据点。但是，我发现当我将数据栅格化并另存为 PDF 时，误差线会产生难看的白色轮廓，这对于发布是不可接受的。我已经构建了一个显示问题的 MWE：

import numpy as np
import random as rand
import matplotlib.pyplot as plt

rand.seed(10)
seeds = range(0, 1000)
data = np.empty((len(seeds), 2))
for n in seeds:
    data[n, 0] = rand.gauss(1, 0.01)
    data[n, 1] = rand.gauss(1, 0.01)

fig, ax = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6))

ax.scatter(data[:, 0], data[:, 1], s=10, facecolors="k", rasterized=True, zorder=1)
ax.errorbar(data[:, 0], data[:, 1], xerr=0.01, yerr=0.01, color="k", fmt="none", rasterized=True, zorder=2)

fig.savefig("Test.pdf", dpi=250)

这在 Jupyter Notebook 输出中看起来不错，并且还保存为 PNG 文件。然而，输出的 PDF 文件如下所示：如何摆脱由误差线引起的白色绒毛？如果我不进行光栅化，问题就会消失，但是文件需要很长时间才能加载到我的论文中，我最不想做的就是惹恼我的读者。

【问题讨论】：

您是否尝试过另存为 PNG？
是的，将其保存为 PNG确实解决了问题，但我希望框架的 PDF 具有灵活性和分辨率。另外，无论如何这只是无意的行为，所以我更喜欢适当的解决方案。
您可以任意设置 PNG 的分辨率，然后将其插入 PDF。只是说。

标签： python matplotlib errorbar rasterizing savefig

【解决方案1】：

感谢an older question，我找到了解决方案：我需要在代码中添加ax.set_rasterization_zorder(0)，并将绘制点的 zorder 更改为低于 0。这产生了一个完美的图表，没有丑陋的数据轮廓和保留一个矢量化轴，正是我想要的。工作代码是：

import numpy as np
import random as rand
import matplotlib.pyplot as plt

rand.seed(10)
seeds = range(0, 1000)
data = np.empty((len(seeds), 2))
for n in seeds:
    data[n, 0] = rand.gauss(1, 0.01)
    data[n, 1] = rand.gauss(1, 0.01)

fig, ax = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6))

ax.scatter(data[:, 0], data[:, 1], s=10, facecolors="k", rasterized=True, zorder=-2)
ax.errorbar(data[:, 0], data[:, 1], xerr=0.01, yerr=0.01, color="k", fmt="none", rasterized=True, zorder=-1)

ax.set_rasterization_zorder(0)

fig.savefig("Test.pdf", dpi=250)

输出为：

【讨论】：