如何修复 Python Numpy/Pandas 安装？答案

【问题标题】：How to fix Python Numpy/Pandas installation?如何修复 Python Numpy/Pandas 安装？
【发布时间】：2012-09-08 08:30:01
【问题描述】：

我想在 Mac OS X 10.6.8 上安装 Python Pandas 库 (0.8.1)。这个库需要 Numpy>=1.6。

我试过了

$ sudo easy_install pandas
Searching for pandas
Reading http://pypi.python.org/simple/pandas/
Reading http://pandas.pydata.org
Reading http://pandas.sourceforge.net
Best match: pandas 0.8.1
Downloading http://pypi.python.org/packages/source/p/pandas/pandas-0.8.1.zip#md5=d2c5c5bea971cd760b0ae6f6850fcb74
Processing pandas-0.8.1.zip
Running pandas-0.8.1/setup.py -q bdist_egg --dist-dir /tmp/easy_install-ckAMym/pandas-0.8.1/egg-dist-tmp-0mlL7t
error: Setup script exited with pandas requires NumPy >= 1.6 due to datetime64 dependency

所以我尝试安装 Numpy

$ sudo easy_install numpy
Searching for numpy
Best match: numpy 1.6.2
Adding numpy 1.6.2 to easy-install.pth file

Using /Library/Python/2.6/site-packages
Processing dependencies for numpy
Finished processing dependencies for numpy

所以我又试了一次

$ sudo easy_install pandas

但问题还是一样！

error: Setup script exited with pandas requires NumPy >= 1.6 due to datetime64 dependency

我运行 Python

$ python
Python 2.6.1 (r261:67515, Jun 24 2010, 21:47:49) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5646)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy as np
>>> np.__version__
'1.2.1'

所以 Numpy 1.6 似乎没有正确安装！

我尝试使用pip（而不是easy_install）安装 Numpy 1.6...

$ sudo pip install numpy
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): numpy in /Library/Python/2.6/site-packages
Cleaning up...

我添加了--upgrade 标志

$ sudo pip install numpy --upgrade
Requirement already up-to-date: numpy in /Library/Python/2.6/site-packages
Cleaning up...

$ sudo pip install pandas
Downloading/unpacking pandas
  Downloading pandas-0.8.1.zip (1.9MB): 1.9MB downloaded
  Running setup.py egg_info for package pandas
    pandas requires NumPy >= 1.6 due to datetime64 dependency
    Complete output from command python setup.py egg_info:
    pandas requires NumPy >= 1.6 due to datetime64 dependency

----------------------------------------
Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /tmp/pip-build/pandas
Storing complete log in /Users/MyUsername/Library/Logs/pip.log

我还尝试安装二进制版本的 Numpy http://sourceforge.net/projects/numpy/files/ numpy-1.6.2-py2.6-python.org-macosx10.3.dmg 但它失败了！！！（安装人员说不能在这个磁盘上安装numpy 1.6.2。numpy需要python.org Python 2.6才能安装。

【问题讨论】：

你以前安装过 numpy 吗？也许这把事情搞砸了。您应该尝试卸载 numpy，然后重新安装最新版本。
我有一个以前的 Numpy 版本 1.2.1，但我不记得这个版本是如何安装的（来自源代码、easy_install、pip、二进制...）。非常奇怪的是我无法安装二进制文件（请参阅我刚刚编辑的帖子的最后一部分）
NumPy 1.2.1 安装在哪里 (import numpy as np; print np)？我建议使用像 EPDFree 或 Anaconda CE 这样的打包发行版，并尽可能避免使用 Apple 的系统 Python
>>> import numpy as np >>> np.__version__ '1.2.1' >>> print(np) <module 'numpy' from '/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/Extras/lib/python/numpy/__init__.pyc'> 所以不知道是怎么安装的
很好 Wes 建议我使用 EPD...我安装了 Academic 版本（它似乎比 EPD Free 更好）...$ sudo enpkg numpy 安装了我 numpy 但$ sudo enpkg pandas 返回@ 987654336@!!!

标签： python numpy pip pandas easy-install

【解决方案1】：

不知道你是否解决了这个问题，但将来是否有人遇到这个问题。

$python
>>import numpy
>>print(numpy)

转到打印的位置并删除在那里找到的numpy 安装。然后您可以使用pip 或easy_install

【讨论】：

这仍然适用于 Mavericks，只是想补充一点，我必须删除指示的文件夹并运行 pip uninstall numpy。然后运行pip install numpy 处理它。
非常感谢！我不知道为什么我的默认 numpy 转到了非 Anaconda 版本，尽管 Anaconda 是我的默认 Python 版本...
我不认为这个解决方案可以解决问题，因为它通常是没有正确设置 PATH 目录的情况。此外，此解决方案是特定于包的，对每个包执行相同的过程会很麻烦
pip install --force-reinstall numpy 也可以吗？

【解决方案2】：

我遇到了这个确切的问题。

问题是在默认的 mac 安装中有一个旧版本的 numpy，pip install pandas 首先看到了一个并且失败了——没有继续看到pip 自己有一个新版本安装。

如果您使用默认的 mac 安装，并且您已完成 pip install numpy --upgrade 以确保您是最新的，但由于旧的 numpy，pip install pandas 仍然失败，请尝试以下操作：

$ cd /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/
$ sudo rm -r numpy
$ pip install pandas

现在应该安装/构建 pandas。

要检查我们所做的工作，请执行以下操作：启动 python，然后 import numpy 和 import pandas。运气好的话，numpy.__version__ 将是 1.6.2（或更高），pandas.__version__ 将是 0.9.1（或更高）。

如果您想查看 pip 将它们放在（找到！）它们的位置，只需 print(numpy) 和 print(pandas)。

【讨论】：

从 /System 中删除东西是个坏主意。
@rspeer -- 当然，但您还有什么建议？ OP 询问他如何绕过 pandas 安装程序正在查找旧版本的 numpy 的事实——这解决了这个问题。
如果你的“唯一选择”是从系统中删除东西，那么你应该安装一个非系统python（除非你真的知道你在做什么，包括苹果未来更新的风险破坏东西）。然而，正如@sjs 的回答所展示的，这不是这里唯一的选择。
在我的新 10.8.2 / dev 熊猫上，这不是问题。自从破解了我的 10.7.x 笔记本电脑以这种方式工作以来，我的笔记本电脑没有任何问题。
始终可以选择移动/重命名文件以将其删除。

【解决方案3】：

我与创建Anaconda Python 的人一起工作。您可以安装多个版本的 python 和 numpy，而不会损坏您的系统 python。它是免费和开源的（OSX、linux、Windows）。付费包是免费版本之上的增强功能。包括熊猫。

conda create --name np17py27 anaconda=1.4 numpy=1.7 python=2.7
export PATH=~/anaconda/envs/np17py27/bin:$PATH

如果你想要 numpy 1.6：

conda create --name np16py27 anaconda=1.4 numpy=1.6 python=2.7

设置你的 PATH 设置在哪里可以找到 python 和 ipython。环境 (np17py27) 可以任意命名。

【讨论】：

我在使用 Anaconda 和多个版本的 Python 时度过了一段糟糕的时光——它改变了我的默认 Python 发行版并弄乱了每个版本中的依赖关系。我会尝试手动安装它。
很抱歉发生了这种情况。搞乱依赖是什么意思？您应该能够卸载 Anaconda（它只是一个目录）以撤消任何更改。安装程序应该询问您是否要将其设为您的 shell 的默认值。在 OSX 或 Linux 上，它通过将 PATH 添加到 ~/.bash_profile 来实现。

【解决方案4】：

这对我在 10.7.5 下使用 Enthought 的 EPD_free-7.3-2 有效：

免费安装 EPD，然后按照以下链接中的步骤创建 .bash_profile 文件。

http://redfinsolutions.com/blog/creating-bashprofile-your-mac

并将以下内容添加到文件中。

PATH="/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/bin:$(PATH)}"
export PATH

在终端中执行以下命令

$ sudo easy_install pandas

完成后，启动 PyLab 并输入：

In [1]: import pandas

In [2]: plot(arange(10))

这应该会打开一个带有对角直线的图。

【讨论】：

【解决方案5】：

如果您像我一样不喜欢删除标准系统安装中的内容（其他人建议），那么您可能会喜欢我最终使用的解决方案：

获取Homebrew - 这是一个可以安装的单行shell脚本！
编辑您的.profile 或任何适当的内容，并将/usr/local/bin 放在开头您的PATH 以便在系统二进制文件之前找到Homebrew 二进制文件
brew install python - 这会在 /usr/local 中安装更新版本的 python
pip install pandas

这在 OS X 10.8.2 中对我有用，但我看不出它在 10.6.8 中不适用的任何原因。

【讨论】：

【解决方案6】：

您的系统上可能安装了另一个 Numpy 版本，如果您的发行版不支持，请尝试查询您的 numpy 版本并检索它。
aka debian/unbuntu/Mint 版本主要可以从 dpkg 包管理器中查询： dpkg --get-selections | egrep -i "numpy"，您可以看到实际的 Numpy 版本。

有些拥有 apt 的用户可以通过执行以下操作要求删除它：apt-get remove numpy。
有些发行版如 Fedora、RedHat 和任何 RedHat 模型下的兼容发行版也可以使用 rpm 来查询安装。
这是通过告诉 Numpy 安装程序在当前的/usr/local/lib/python[VERSION]/dist-packages over Linux env 和c:[...]\python[VERSION]\site-packages for windows 上安装自身而发生的。在 /usr/local/python[VERSION]/dist-packages 中可能安装了 Numpy 的一个版本，这个版本将首先被实例化。
.pth 文件包含有关特定 python 模块路径位置的信息，但是从包中删除组件可能会损坏它...

小心，你将不得不删除包和它的所有依赖......在某些情况下真的很痛苦。

访问lunchad.net 可能会节省您的时间，有时他们会从某些软件包中获得新版本。

【讨论】：

【解决方案7】：

我遇到了同样的问题，就我而言，问题是 python 在一些有序的位置寻找包，首先是默认旧包所在的默认计算机。

要检查你的 python 正在寻找什么，你可以这样做：

>>> import sys
>>> print '\n'.join(sys.path)

这是在 pip 或 brew 或 port 文件夹之前输出目录“/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python”。

简单的解决办法是：

export PYTHONPATH="/Library/Python/2.7/site-packages:$PYTHONPATH"

这对我来说效果很好，我建议您下次将此行添加到您的家庭 bash_profile 文件中。请记住，sys.path 是使用当前工作目录构建的，然后是 PYTHONPATH 环境变量中的目录。然后是依赖安装的默认目录。

【讨论】：

【解决方案8】：

如果您使用的是 enthought python (EPD) 版本，您可能希望直接转到您的站点包并重新安装 numpy。然后尝试使用 pip 安装 pandas。您必须为此修改安装前缀。

如果问题仍然存在（就像我一样），请尝试下载 pandas tar 球，将其解压缩到您的站点包中，然后从您的 pandas 目录运行 setup.py install。

如果您的依赖项正确，您可以导入 pandas 并检查它是否顺利导入。

【讨论】：

【解决方案9】：

与几乎所有其他 Python 软件包一样，安装 Pandas 的最简单方法是使用 pip。

许多包（包括 Pandas）需要编译器和一堆第三方 DLL，许多 Windows 用户不知道如何处理。这正是创建“wheel”格式的原因：因此包可以上传预构建的二进制文件。

并不是每个项目都为 Windows 预先构建了二进制轮子。但是您可以查看 Christoph Gohlke 的网站并找到所有最受欢迎的轮子。只需按照该页面上的说明下载轮文件并使用 pip 安装即可。

但对于 Pandas，您不必这样做。他们的下载页面上有轮子，并上传到 PyPI。文档告诉您使用这些。（嗯，它首先建议你使用 Anaconda/Miniconda，但如果你想要一个普通的 Python，请使用 pip 和 PyPI 上的包。）它对我有用......在 windows 7 64 位，python 3.4

【讨论】：

【解决方案10】：

对我来说真正有用的是在这样的虚拟环境中安装 pandas：

// create your virtualenv folder
python3 -m venv your-virtualenv-folder


// activate your virtualenv folder
source your-virtualenv-folder/bin/activate

// install pandas on your new virtualenv folder
python -m pip install pandas

// run your python file
python index.py

【讨论】：