【问题标题】:Indexing a list with another list which contains arrays用另一个包含数组的列表来索引一个列表
【发布时间】:2016-10-29 11:50:07
【问题描述】:

尊敬的论坛,我想用注释列表索引患者数据列表,其中每个元素都是一个 nx1 数组。

患者名单:例如10 个患者,20 个特征,300 个数据点(列表的每个元素都是一个 300x20 数组) 注释列表:例如10 位患者,300 条注释

目的是创建一个包含患者值的列表,其中的值由以下人员选择:

  • 我想要的病人
  • 我想要的功能
  • 我想要的带注释的数据

在这个很棒的论坛的帮助下,我设法选择了患者和特征(F1、F2、F3):

 F1=5;F2=13;F3=74     
 selected_babies =[0,1,2]
 Xfeat=[val[:,(F1,F2,F3)] for sb, val in enumerate(Patient_Matrix) if sb in selected_babies] #selecting top three fearues F1 F2 F3 datapoints

然后我创建一个列表,其中包含与我想要的注释相对应的索引。在本例中为 1 和 2。

label=array([1,2])
idx=[in1d(Annottions[sb],label) for sb in selected_babies]
idx=[nonzero(idx[sb])[0] for sb in selected_babies] # get the indices where True

如前所述,idx 现在是一个包含 3 个元素的列表(由于 selected_babies),其中每个元素都是一个包含 n 个值的数组,表示我要使用的数据的索引。 现在我想使用这个列表从创建的 Xfeat 中选择我的数据。 到目前为止,它包含特征 F1、F2 和 F3 的所有值。我只想要 selected_baby 的 F1、F2、F3 的 1 和 2 注释值。

我试过了:

Xfeat=[val[idx[sb],:] for sb, val in enumerate(Patient_Matrix) if sb in selected_babies]    #selecting the datapoints in label

但它不起作用。 IndexError:索引 0 超出轴 0 的范围,大小为 0。

有谁知道如何正确地做到这一点?

非常感谢您提前提供的帮助。

【问题讨论】:

    标签: python arrays list indexing


    【解决方案1】:

    我似乎在处理这个:

    Xfeat=[val[idx[sb],:] for sb, val in enumerate(Xfeat) if sb in selected_babies]
    

    我仍然收到 indexError,但仅针对特定患者。我必须弄清楚那里会发生什么。 希望我能帮助别人。

    干杯

    【讨论】:

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