R - iGraph 不绘图（“无效的 RGB 规范”）答案

【问题标题】：R - iGraph does not plot ("invalid RGB specification")R - iGraph 不绘图（“无效的 RGB 规范”）
【发布时间】：2016-03-12 05:52:00
【问题描述】：

我正在尝试用两种类型的节点（投资者对公司进行投资）来可视化一个大型网络。为了增加可见性，我想根据它们结束的节点为边缘着色。

edge.end <- get.edges(g, 1:ecount(g))[,1] # g is my igraph element
E(g)$color <- V(g)$color[edge.end] # edge color based on vector color

这可以完美运行并返回 32,000 多个十六进制颜色代码。

[1] "#FFF5F0" "#FFF5F0" "#FFF5F0" ...

由于图表现在非常拥挤，我想根据各自的投资规模使边缘透明。透明度应在 0.5 和 1 之间。为此，我使用 GISTools：

E(g)$color <- add.alpha(E(g)$color, ((0.5*(E(g)$Invested.Amount.in.EUR - min(E(g)$Invested.Amount.in.EUR))) / (max(E(g)$Invested.Amount.in.EUR)-min(E(g)$Invested.Amount.in.EUR)))+0.5)

这似乎有效并返回：

[1] "#FFF5F0BF" "#FFF5F0B3" "#FFF5F099" ...

但是，当我现在使用以下代码绘制图表时（在添加透明度之前效果很好）

pdf('all.pdf')
plot(g, layout = layout_with_fr(g, niter = 1000, weights = E(g)$width))
dev.off()

R 返回以下错误：

Error in plot.xy(xy.coords(x, y), type = type, ...) : 
  invalid RGB specification

如果我只是用例如“#63636309”覆盖 E(g)$color，它就可以完美地工作...... 谁能指出我正确的方向来解决这个问题？

非常感谢，一月

【问题讨论】：

你能否提供一个小代码sn-p，其中包含可重现的数据？我不清楚哪种颜色会引发错误。
这似乎是 GISTools 包中的问题。我现在正在使用带有以下公式E(g)$color <- alpha(E(g)$color, ((0.8*(E(g)$Invested.Amount.in.EUR - min(E(g)$Invested.Amount.in.EUR))) / (max(E(g)$Invested.Amount.in.EUR)-min(E(g)$Invested.Amount.in.EUR)))+0.2) 的 scales 包，它运行顺利！
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标签： r plot colors transparency igraph

【解决方案1】：

这似乎是 GISTools 包中的问题。我现在正在使用带有以下公式的 scales 包

E(g)$color <- alpha(E(g)$color, ((0.8*(E(g)$Invested.Amount.in.EUR - min(E(g)$Invested.Amount.in.EUR))) / (max(E(g)$Invested.Amount.in.EUR)-min(E(g)$Invested.Amount.in.EUR)))+0.2)

而且运行顺畅！

【讨论】：