在 Virtualenv Numpy 中从 Flask 导入 Numpy 时出现多数组导入错误

Question

我正在尝试在烧瓶 __init__.py 导入 numpy，但它给出了这个错误：

Importing the multiarray numpy extension module failed.  Most
likely you are trying to import a failed build of numpy.
If you're working with a numpy git repo, try `git clean -xdf` (removes all 
files not under version control).  Otherwise reinstall numpy.

当我从烧瓶 __init__.py 中删除导入时，一切正常。 当我在 virtualenv 中执行 from numpy.core import multiarray 时，一切正常，但从 wsgi 导入它不起作用。

这里是 apache/站点可用的配置文件：

<VirtualHost *:80>
                ServerName 192.168.0.1
                ServerAdmin hello@world.com
                WSGIScriptAlias / /home/bar/FlaskApp/FlaskApp/FlaskApp.wsgi
                <Directory /home/bar/FlaskApp/FlaskApp/>
                        Require all granted
                </Directory>
                Alias /static /home/bar/FlaskApp/FlaskApp/static
                <Directory /home/bar/FlaskApp/FlaskApp/static/>
                        Require all granted
                </Directory>
                ErrorLog ${APACHE_LOG_DIR}/error.log
                LogLevel warn
                CustomLog ${APACHE_LOG_DIR}/access.log combined
</VirtualHost>
WSGIDaemonProcess FlaskApp python-path=/home/bar/FlaskApp:/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages
WSGIProcessGroup FlaskApp

这里是wsgi文件：

#!/usr/bin/python
import sys
import logging
logging.basicConfig(stream=sys.stderr)
sys.path.insert(0,"/home/bar/FlaskApp")

from FlaskApp import app as application
application.secret_key = 'FlaskApp'

谢谢

附加信息： 我在导入其他模块（如 pandas、flask 或 os）时没有问题。 最初我导入熊猫所以错误来自熊猫依赖错误。 来自/var/log/apache/error.log：

Traceback (most recent call last):
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/FlaskApp.wsgi", line 7, in <module>
        from FlaskApp import app as application
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/__init__.py", line 3, in <module>
        from myscript import myclass
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/myscript.py", line 1, in <module>
        import pandas as pd
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages/pandas/__init__.py", line$
        "Missing required dependencies {0}".format(missing_dependencies))
        ImportError: Missing required dependencies ['numpy']

这是我尝试直接从__init__.py 导入 numpy 时的错误日志：

Traceback (most recent call last):
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/FlaskApp.wsgi", line 7, in <module>
        from FlaskApp import app as application
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/__init__.py", line 3, in <module>
        import numpy as np
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages/numpy/__init__.py", line 142, in <module>
        from . import add_newdocs
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages/numpy/add_newdocs.py", line 13, in <module>
        from numpy.lib import add_newdoc
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages/numpy/lib/__init__.py", line 8, in <module>
        from .type_check import *
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages/numpy/lib/type_check.py", line 11, in <module>
        import numpy.core.numeric as _nx
    File "/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages/numpy/core/__init__.py", line 24, in <module>
        raise ImportError(msg)
    ImportError:
    Importing the multiarray numpy extension module failed.  Most
    likely you are trying to import a failed build of numpy.
    If you're working with a numpy git repo, try `git clean -xdf` (removes all
    files not under version control).  Otherwise reinstall numpy.

当我尝试在 python 会话中将 numpy 导入 venv 时，它可以正常工作。

(venv) bar@bar:~/FlaskApp/FlaskApp$ python3
Python 3.5.2 (default, Nov 17 2016, 17:05:23) 
[GCC 5.4.0 20160609] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy as np
>>> from numpy.core import multiarray
>>> multiarray.__file__
'/home/bar/FlaskApp/FlaskApp/venv/lib/python3.5/site-packages/numpy/core/multiarray.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so'
>>> 

Answer 1

在 mod_wsgi 下导入可能会很棘手，尤其是使用 Python C 扩展库。

这里的问题原来是将WSGIDaemonProcess python-path= 选项设置为带有已编译模块的venv。从这些文档中：

如果使用 Python 虚拟环境，与其使用该选项来引用 Python 虚拟环境的 site-packages 目录，不如使用 python-home 选项来指定 Python 虚拟环境的根目录。

在所有情况下，如果该目录包含具有 C 扩展组件的 Python 包，则必须使用与编译 mod_wsgi 模块时相同的基本 Python 版本安装这些包。您不应混合使用来自不同 Python 版本或安装的包。

因此，python-home= 选项必须用于给定的 venv 目录，并且 Python 2.7 应该用于 venv，或者必须安装 mod_wsgi 的 Python 3 版本（@987654328 @ 在 Ubuntu 上）。

对于某些应用程序，WSGIApplicationGroup 也需要进行如下配置：

WSGIApplicationGroup %{GLOBAL}

在任何 C 扩展使用简化线程 api 的情况下。

从类似的问题，α，β，这似乎是一个常见的问题。