【问题标题】:Creating a column with file name for many dataframes [duplicate]为许多数据框创建带有文件名的列[重复]
【发布时间】:2018-12-14 07:20:30
【问题描述】:

我目前正在使用 R Studio 版本 1.0.143 和 R 版本 3.4.4。

我正在尝试创建一个 apply() 函数,它对许多文件执行以下操作:

df1 <- read_excel("Sample 1.xlsx")
df1["Sample"] <- "Sample 1"
df2 <- read_excel("Sample 2.xlsx")
df2["Sample"] <- "Sample 2"
rbind(df1, df2) -> final

一个向数据框添加一列的函数,用于通知变量属于哪个样本,因为之后我将绑定所有样本。此功能不仅要读取许多excel文件,而且要在每个文件中添加一个带有文件名的列(例如)。我在其他问题中找不到类似的东西

我尝试使用 lapply,但没有成功。我需要这个,因为我想合并 100 多个数据帧(我可以手动完成,但不使用 apply 似乎很愚蠢)。 所有文件都具有相同的列,因此不需要在一个文件中不存在列时放置 NA 的函数。

【问题讨论】:

  • 将许多文件读入 R 是 StackOverflow 的 R 标记问题中被问到最多的问题之一。

标签: r loops dataframe apply


【解决方案1】:
names <- c("Sample 1", "Sample 2")

out_l <- lapply(names, function(x) {
  tmp_df <- read_excel(paste0(x, ".xlsx"))
  tmp_df[["Sample"]] <- x
  tmp_df
})
out_df <- do.call(rbind.data.frame, out_l)

或者根据@Parfait 的评论使用较短的版本

names <- c("Sample 1", "Sample 2")

out_l <- lapply(names, function(x) {
  transform(read_excel(paste0(x, ".xlsx")), Sample = x)
})
out_df <- do.call(rbind.data.frame, out_l)

【讨论】:

  • 或使用transformwithin 用于lapply 内的一个衬垫:transform(read_excel(paste0(x, ".xlsx")), Sample = x)
  • 确实如此。我试图坚持与 OP 类似的格式,以便在熟悉的基础上进行优化。
  • 作为参考,names 是一个向量,而不是一个数据框。
  • 我尝试了一些不同的方法,因此我不必创建“名称”数据框。 dta_files &lt;- list.files('C:/Users, pattern = 'Sample', full.names = F) out_l &lt;- lapply(dta_files, function(x) { transform(read_excel(paste0(x)), Sample = x) }) out_df &lt;- do.call(rbind.data.frame, out_l) 这给了我一个包含每个文件名的列(示例 1.xlxs),这似乎足够好
  • 是的,list.files() 是另一种有用且常见的方法。
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